tailieunhanh - Phân tích hệ gen phiên mã của tôm sú cái (Penaeus monodon) ở Việt Nam liên quan đến tính trạng sinh sản bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới

Tôm sú (Penaeus monodon) là loài tôm được nuôi phổ biến ở nước ta và trên thế giới. Hiện nay, sản xuất giống tôm sú vẫn phụ thuộc vào nguồn tôm bố mẹ tự nhiên bởi vì chất lượng sinh sản của tôm tự nhiên cao hơn tôm sú gia hóa. Trước thực tế đó, nhóm tác giả đã tiến hành nghiên cứu hệ gen phiên mã của tôm sú cái tự nhiên và gia hóa ở giai đoạn buồng trứng tiền thành thục bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới. | DOI 12 .47-51 Khoa học Nông nghiệp Phân tích hệ gen phiên mã của tôm sú cái Penaeus monodon ở Việt Nam liên quan đến tính trạng sinh sản bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới Nguyễn Minh Thành1 Trần Thị Hải Yến1 Võ Thị Minh Thư1 2 Lê Thị Hồng Thắm1 Nguyễn Văn Sáng3 Nguyễn Thành Luân3 Nguyễn Việt Tuấn2 1 Khoa Công nghệ Sinh học Trường Đại học Quốc tế Đại học Quốc gia TP Hồ Chí Minh 2 Trung tâm Nghiên cứu GeneCology Đại học Sunshine Coast Australia 3 Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản 2 RIA2 Ngày nhận bài 20 7 2021 ngày chuyển phản biện 22 7 2021 ngày nhận phản biện 25 8 2021 ngày chấp nhận đăng 30 8 2021 Tóm tắt Tôm sú Penaeus monodon là loài tôm được nuôi phổ biến ở nước ta và trên thế giới. Hiện nay sản xuất giống tôm sú vẫn phụ thuộc vào nguồn tôm bố mẹ tự nhiên bởi vì chất lượng sinh sản của tôm tự nhiên cao hơn tôm sú gia hóa. Trước thực tế đó nhóm tác giả đã tiến hành nghiên cứu hệ gen phiên mã của tôm sú cái tự nhiên và gia hóa ở giai đoạn buồng trứng tiền thành thục bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới. Giải trình tự bằng thiết bị Illumina đạt số lượng đoạn trình tự read sau tinh sạch là cho tôm tự nhiên và cho tôm gia hóa. Kết quả lắp ráp theo phương pháp không có hệ gen tham chiếu đạt contig trong đó độ dài trung bình và N50 của contig lần lượt là và bp. Chú giải gen chức năng dựa vào 7 cơ sở dữ liệu đạt tỷ lệ tương đồng từ 19 74 đến 47 77 . Hệ gen phiên mã của nghiên cứu này có tỷ lệ tương đồng cao nhất với loài Hyalella azteca Cryptotermes secundus Zootermopsis nevadensis và các loài tôm thuộc họ Penaeus. Nghiên cứu cũng xác định được tổng cộng gen có biểu hiện khác biệt ở tôm tự nhiên khi so sánh với tôm gia hóa. Các gen có biểu hiện khác biệt được tiếp tục phân loại dựa theo khóa thuật ngữ của Gene Ontology GO . Kết quả phân loại chức năng theo GO ở tôm sú tự nhiên cho thấy các gen hemolymph clottable peritrophin ecdysteroid có biểu hiện tăng và các gen serine protease .

TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
15    174    0    28-03-2024
23    147    0    28-03-2024
37    146    0    28-03-2024
37    128    0    28-03-2024
33    114    0    28-03-2024
173    94    0    28-03-2024
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.