tailieunhanh - Nghiên cứu xác định các vùng EST-SSR đặc trưng của loài sâm Ngọc Linh (Panax vietnamensis Ha & Grushv) bằng phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới

Bài viết Nghiên cứu xác định các vùng EST-SSR đặc trưng của loài sâm Ngọc Linh (Panax vietnamensis Ha & Grushv) bằng phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới trình bày việc giải mã trình tự hệ gen phiên mã (cDNA) của sâm Ngọc Linh bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới (Next-generation sequencing) trên hệ thống Illumina HiSeqTM 4000 nhằm xác định các vùng SSR (Simple sequence repeat) đặc trưng của loài sâm này. | Khoa học Tự nhiên DOI 3 .16-20 Nghiên cứu xác định các vùng EST-SSR đặc trưng của loài sâm Ngọc Linh Panax vietnamensis Ha amp Grushv bằng phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới Nguyễn Thị Phương Trang1 2 Nguyễn Hùng Mạnh1 Bùi Thu Hà3 1 Viện Sinh thái và Tài nguyên Sinh vật Viện Hàn lâm KH amp CN Việt Nam 2 Học viện KH amp CN Viện Hàn lâm KH amp CN Việt Nam 3 Khoa Sinh học Trường Đại học Sư phạm Hà Nội Ngày nhận bài 20 9 2021 ngày chuyển phản biện 24 9 2021 ngày nhận phản biện 22 10 2021 ngày chấp nhận đăng 27 10 2021 Tóm tắt Sâm Ngọc Linh Panax vietnamensis Ha amp Grushv là loài đặc hữu có phân bố hẹp. Do có nhiều công dụng nên giá thành sâm Ngọc Linh cao và hiện đã xuất hiện nhiều mẫu làm giả loài sâm này mẫu giả được sử dụng là loài hoặc phân loài khác cùng trong chi sâm có phân bố ở Việt Nam . Vì vậy việc nhận biết chính xác loài sâm Ngọc Linh là rất quan trọng. Trong nghiên cứu này các tác giả thực hiện giải mã trình tự hệ gen phiên mã cDNA của sâm Ngọc Linh bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới Next-generation sequencing trên hệ thống Illumina HiSeqTM 4000 nhằm xác định các vùng SSR Simple sequence repeat đặc trưng của loài sâm này. Kết quả đã giải mã được đoạn đọc với tổng khối lượng là 7 08 Gb và tổng hợp thành gen chức năng 133 Mb . Trong đó đã xác định được 101 vùng SSR lặp đặc trưng của sâm Ngọc Linh. Từ khóa ETS-SSR giải trình tự ITS sâm Ngọc Linh Panax vietnamensis Ha amp Grushv . Chỉ số phân loại Đặt vấn đề phiên mã EST-SSRs có thể giúp tăng cường khả năng nhận dạng loài. Ngoài ra các chỉ thị EST-SSR được thiết Sâm Ngọc Linh là loài đặc hữu chỉ phân bố ở núi Ngọc kế dành riêng cho một loài thường biểu thị mức độ đa hình Linh thuộc tỉnh Quảng Nam và Kon Tum của Việt Nam 1 . đặc trưng do vị trí của chúng trong các vùng gen được xác Các nghiên cứu đã có đều cho thấy Sâm Ngọc Linh là loài định là đặc thù. Với tính đặc hiệu ưu việt đó mà đã có một có tính đa dạng di truyền cao và có hàm lượng saponin nhiều số .