tailieunhanh - Đa dạng di truyền cừu Phan Rang dựa vào trình tự nucleotide gen coi ở ty thể

Bài viết Đa dạng di truyền cừu Phan Rang dựa vào trình tự nucleotide gen coi ở ty thể nghiên cứu này nhằm bước đầu khảo sát đa dạng di truyền nucleotide thuộc trình tự vùng gen COI (cytochrome oxidase subunit 1) trên ty thể của cừu Phan Rang nuôi tại Ninh Thuận. | DI TRUYỀN - GIỐNG VẬT NUÔI ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỪU PHAN RANG DỰA VÀO TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE GEN COI Ở TY THỂ Nguyễn Ngọc Tấn1 Lê Văn Lộc1 Lê Tấn Lợi1 Trần Thị Vũ1 và Hoàng Tuấn Thành1 Ngày nhận báo cáo 30 10 021 Ngày nhận bài phản biện 28 11 2021 Ngày bài báo được chấp nhận đăng 30 11 2021 TÓM TẮT Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm bước đầu khảo sát đa dạng di truyền nucleotide thuộc trình tự vùng gen COI cytochrome oxidase subunit 1 trên ty thể của cừu Phan Rang nuôi tại Ninh Thuận. Cặp mồi được thiết kế để khuyếch đại đoạn gen mục tiêu có kích thước khoảng 882bp. Hai mươi mẫu cá thể cừu đã được phân tích và kết quả cho thấy tỷ lệ thành phần các loại nucleotide Adenine A 27 7 Thymine T 31 2 Cytosine C 23 9 Guanine G 17 2 và chỉ số đa dạng nucleotide p là 0 002. Có 10 vị trí biến đổi đa hình nucleotide và 4 haplotype đã quan sát được với chỉ số đa dạng haplotype Hd là 0 500 0 122. Khoảng cách di truyền giữa cừu thuần Arab và cừu lai Úc là lớn nhất d 0 00386 0 00060 kế đến là giữa nhóm cừu lai Arab và cừu thuần Arab 0 00342 0 00034 hoặc cừu Phan Rang và cừu thuần Arab d 0 00334 0 00003 và thấp nhất giữa cừu Phan Rang với cừu lai Úc d 0 00103 0 0002 hoặc cừu lai Arab d 0 00111 0 00022 . Kết quả cây di truyền cho thấy hầu hết các cá thể cừu Phan Rang tập trung thành 01 nhánh lớn và có quan hệ gần với nhóm cừu Châu Á. Việc gia tăng dung lượng mẫu và mở rộng vùng thu nhận mẫu để phân tích là điều cần thiết cho nghiên cứu tiếp theo. Từ khóa Cừu Phan Rang hệ gen ty thể gen cytochrome oxidase subunit 1 COI đa dạng di truyền. ABSTRACT Genetic diversity of Phan Rang sheep on mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 COI gene based on nucleotide sequencing The aim of this study was to investigate the genetic diversity of Phan Rang sheep at Ninh Thuan province of Vietnam based on mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 gene COI by nucleotide sequencing. The primers were designed to amplify .