tailieunhanh - Metagenomics - phương pháp phân tích hệ vi sinh môi trường có nhiều tiềm năng ứng dụng trong thú y

Bài viết Metagenomics - phương pháp phân tích hệ vi sinh môi trường có nhiều tiềm năng ứng dụng trong thú y trình bày kết quả từ hai nghiên cứu ban đầu, cho thấy tiềm năng ứng dụng của metagenomics trong lĩnh vực thú y. Trong nghiên cứu đầu tiên, chúng tôi sử dụng phương pháp 16s rRNA metagenomics để phân tích các mẫu sữa từ bò lành, bò viêm vú nhẹ và bò viêm vú nặng. | HỘI NGHỊ KHOA HỌC CHĂN NUÔI THÚ Y TOÀN QUỐC 2021 - AVS2021 126-132 METAGENOMICS - PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH HỆ VI SINH MÔI TRƯỜNG CÓ NHIỀU TIỀM NĂNG ỨNG DỤNG TRONG THÚ Y Huỳnh Văn Phúc1 Lê Lan Anh1 Nguyễn Thụy Vy2 Nguyễn Thị Diệu Ái1 Trần Huỳnh Bảo Nam1 và Hồ Huỳnh Thùy Dương2 Tóm tắt Metagenomics phương pháp phân tích hệ vi sinh trong mẫu thông qua các trình tự DNA đặc trưng thu nhận được cho phép đồng thời xác định sự hiện diện các vi sinh vật trong mẫu cũng như dự đoán các con đường chức năng của chúng. Trong báo cáo này chúng tôi trình bày kết quả từ hai nghiên cứu ban đầu cho thấy tiềm năng ứng dụng của metagenomics trong lĩnh vực thú y. Trong nghiên cứu đầu tiên chúng tôi sử dụng phương pháp 16s rRNA metagenomics để phân tích các mẫu sữa từ bò lành bò viêm vú nhẹ và bò viêm vú nặng. Kết quả cho thấy một mẫu sữa từ bò viêm vú nặng có sự hiện diện của chi Pseudomonas spp. với tỉ lệ rất cao 96 7 . Trong nghiên cứu thứ hai bằng cách sử dụng phương pháp shotgun metagenomics chúng tôi đã xác định được một số tác nhân gây bệnh chưa được ghi nhận trước đây trên mẫu phân mèo bị tiêu chảy bao gồm Escherichia virus Goslar và Protoparvovirus sp. Bên cạnh đó kết quả phân tích còn cho thấy sự xuất hiện của một số gene kháng kháng sinh trong hệ vi sinh ở phân mèo bệnh. Như vậy metagenomics không chỉ cho phép nhận diện các chỉ dấu vi sinh đặc trưng cho tình trạng sức khoẻ ở vật nuôi mà còn đặc biệt hữu ích khi cần phát hiện tác nhân gây bệnh mới. Từ khóa Bò sữa viêm vú giải trình tự thế hệ mới metagenomics mèo. METAGENOMICS - A METHOD FOR ANALYSIS OF MICROBIAL COMMUNITIES HAS A LOT OF POTENTIAL APPLICATIONS IN VETERINARY FIELD Abstract Metagenomics a method of analyzing the microbiome in a sample through the obtained specific DNA sequences allows simultaneously determining the presence of microorganisms in the sample as well as predicting their functional pathways. In this report we present results from two initial studies suggesting the potential application of metagenomics in