tailieunhanh - Đánh giá ảnh hưởng của một số kim loại và hóa chất đến hoạt tính của endoglucanase GH5 được khai thác từ dữ liệu DNA metagenome vi khuẩn dạ cỏ dê

Để nghiên cứu ảnh hưởng của một số ion kim loại và hóa chất đến hoạt tính của enzyme, kết quả dựa trên dựa đoán nhanh cấu trúc phân tử của trình tự endoglucanase GH5 bằng Swiss-Prot, ProFunc và COFACTOR cho thấy enzyme có hai gốc amino acid bảo thủ (Asp-190 và Asp-192) liên kết với Mn2+ trong khoảng bán kính 3,5 Å từ tâm của ion Mn2+ và có chứa một cầu disulphide trong phân tử. | Tạp chí Công nghệ Sinh học 19 3 509-517 2021 ĐÁNH GIÁ ẢNH HƯỞNG CỦA MỘT SỐ KIM LOẠI VÀ HÓA CHẤT ĐẾN HOẠT TÍNH CỦA ENDOGLUCANASE GH5 ĐƯỢC KHAI THÁC TỪ DỮ LIỆU DNA METAGENOME VI KHUẨN DẠ CỎ DÊ Nguyễn Khánh Hoàng Việt1 2 Hà Thị Thúy Hoa1 Trương Nam Hải1 2 Đỗ Thị Huyền1 2 1 Viện Công nghệ sinh học Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam 2 Học viện Khoa học và Công nghệ Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail dohuyen@ Ngày nhận bài Ngày nhận đăng TÓM TẮT Gen mã hóa cho endoglucanase GH5 được khai thác từ dữ liệu DNA metagenome vi khuẩn dạ cỏ dê Việt Nam có cấu trúc module gồm vùng xúc tác cellulase module Fn3 và module X. Enzyme tái tổ hợp đã được biểu hiện thành công trong E. coli và đã được tinh chế. Để nghiên cứu ảnh hưởng của một số ion kim loại và hóa chất đến hoạt tính của enzyme kết quả dựa trên dựa đoán nhanh cấu trúc phân tử của trình tự endoglucanase GH5 bằng Swiss-Prot ProFunc và COFACTOR cho thấy enzyme có hai gốc amino acid bảo thủ Asp-190 và Asp-192 liên kết với Mn2 trong khoảng bán kính 3 5 Å từ tâm của ion Mn2 và có chứa một cầu disulphide trong phân tử. Kết quả nghiên cứu thực nghiệm ảnh hưởng của một số ion kim loại Ca2 Mn2 Mg2 Ni2 K Co2 Cu2 Zn2 Fe3 ở nồng độ cuối cùng là 10 mM và sáu loại hóa chất thường sử dụng là SDS 1 urea 1 µM 2- mercaptoethanol 1 µM EDTA 1 µM tween 80 1mM triton X-100 1 µM lên hoạt tính endoglucanase GH5 cho thấy hoạt tính của enzyme được xác định tăng nhẹ khi sử dụng 10 mM Mn2 và tăng lên 2 lần khi sử dụng 40 mM Mn2 nhưng đều bị giảm khi bổ sung các ion kim loại và hóa chất khác. Mn2 được xác định có thể liên kết đặc thù làm tăng tính ổn định và hoạt tính của endoglucanase GH5. Từ khóa endoglucanase hóa chất ion kim loại ProFunc Swiss-Prot MỞ ĐẦU bằng phần mềm MEGAN cho thấy trình tự có nguồn gốc từ Ruminococcus bicirculans. Khi so Hệ sinh thái mini trong dạ cỏ của động vật sánh trình tự amino acid của enzyme bằng được xác định là lò phản ứng sinh