tailieunhanh - Đa dạng di truyền giống chó H’mông cộc đuôi trên cơ sở giải trình tự nucleotide vùng siêu biến thứ nhất (HV1) của D - loop

Nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền của giống chó H’mông cộc đuôi trên cơ sở giải trình tự nucleotide vùng siêu biến thứ nhất (HV1) trong vùng D-loop thuộc hệ gen ty thể của 45 mẫu thu ngẫu nhiên tại hai tỉnh Hà Giang và Lào Cai cho thấy chó H’mông cộc đuôi có mức độ đa dạng di truyền cao: Chỉ số đa dạng nucleotide (Pi = 0,00801), đa dạng haplotype (Hd = 0,96162) và số nucleotide khác biệt trung bình (Kt = 5,18384). Chó H’mông cộc đuôi đã được xác định mang 25 haplotype khác nhau thuộc nhóm haplotype (A, B, C và E). Mời các bạn tham khảo! | Tạp chí Công nghệ Sinh học 19 2 245-257 2021 ĐA DẠNG DI TRUYỀN GIỐNG CHÓ H MÔNG CỘC ĐUÔI TRÊN CƠ SỞ GIẢI TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE VÙNG SIÊU BIẾN THỨ NHẤT HV1 CỦA D-LOOP Phạm Thanh Hải1 2 Bùi Xuân Phương1 Trần Hữu Côi1 Phùng Thanh Tùng1 Ngô Quang Đức1 Nguyễn Minh Khang3 Vũ Đình Duy1 2 1 Viện Sinh thái nhiệt đới Trung tâm Nhiệt đới Việt - Nga 2 Học viện Khoa học và Công nghệ Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam 3 Hiệp hội những người nuôi chó giống Việt Nam VKA Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail duyvu@ Received Accepted TÓM TẮT Chó H mông cộc đuôi là giống chó bản địa phân bố ở vùng núi phía Bắc Việt Nam sở hữu nhiều đặc tính quý như thông minh nhanh nhẹn có thể lực tốt khả năng thích nghi với điều kiện môi trường tốt thân thiện với con người và đặc biệt chúng có khả năng thực hiện nghiệp vụ. Nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền của giống chó H mông cộc đuôi trên cơ sở giải trình tự nucleotide vùng siêu biến thứ nhất HV1 trong vùng D-loop thuộc hệ gen ty thể của 45 mẫu thu ngẫu nhiên tại hai tỉnh Hà Giang và Lào Cai cho thấy chó H mông cộc đuôi có mức độ đa dạng di truyền cao Chỉ số đa dạng nucleotide Pi 0 00801 đa dạng haplotype Hd 0 96162 và số nucleotide khác biệt trung bình Kt 5 18384 . Chó H mông cộc đuôi đã được xác định mang 25 haplotype khác nhau thuộc nhóm haplotype A B C và E . Trong đó có 7 haplotype mới An1 đến An7 thuộc nhóm haplotype A chưa được công bố và 18 haplotype còn lại đã được ghi nhận trước đây ở các giống chó trên thế giới. Hơn nữa chó H mông cộc đuôi còn mang các haplotype dạng cổ như B1 C2 E1 và E4. Đặc biệt không có cá thể nào mang haplotype dạng D và F. Chó H mông cộc đuôi có 38 vị trí nucleotide đa hình gồm 32 vị trí có các đột biến thay thế nucleotide và 6 vị trí có đột biến mất hay thêm nucleotide. Hầu hết các đột biến thay thế là đồng hoán 31 32 chỉ có 1 vị trí nucleotide có dị hoán. Phân tích phát sinh chủng loài cho thấy chó H mông cộc đuôi có quan hệ rất gần gũi với chó nguồn gốc từ khu vực