tailieunhanh - Phân tích in silico các gene mã hóa protein SWEET ở cây dền lấy hạt (Amaranthus hypochondriacus L.)

Bài viết Phân tích in silico các gene mã hóa protein SWEET ở cây dền lấy hạt (Amaranthus hypochondriacus L.) được nghiên cứu nhằm mục tiêu xác định các gene mã hóa SWEET trong hệ gene của cây dền lấy hạt, phân tích các đặc điểm cấu trúc, sự phân bố của gene cũng như các đặc điểm hóa lý lý thuyết của các protein SWEET ở loài cây này và sự biểu hiện gene. | Tạp chí Khoa học Đại học Huế Khoa học Tự nhiên pISSN 1859-1388 Tập 131 Số 1A 101 108 2022 eISSN 2615-9678 PHÂN TÍCH in silico CÁC GENE MÃ HÓA PROTEIN SWEET Ở CÂY DỀN LẤY HẠT Amaranthus hypochondriacus L. La Việt Hồng1 Cao Phi Bằng2 Chu Đức Hà3 Hoàng Tấn Quảng4 1 Viện Nghiên cứu Khoa học amp Ứng dụng Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2 Tp. Phúc Yên Vĩnh Phúc Việt Nam 2 Khoa Khoa học tự nhiên Trường Đại học Hùng vương Tp. Việt Trì Phú Thọ Việt Nam 3 Khoa Công nghệ Nông nghiệp Trường Đại học Công nghệ ĐHQG Hà Nội 144 Xuân Thủy Hà Nội Việt Nam 4 Viện Công nghệ Sinh học Đại học Huế Tỉnh lộ 10 Phú Thượng Phú Vang Thừa Thiên Huế Việt Nam Tác giả liên hệ La Việt Hồng Ngày nhận bài 08-05-2021 Ngày chấp nhận đăng 06-07-2021 Tóm tắt. SWEET Sugars Will Eventually be Exported Transporter là một trong các họ protein có chức năng vận chuyển đường quan trọng ở thực vật. Trong nghiên cứu này 20 gene mã hóa các protein SWEET trong hệ gene cây dền lấy hạt Amaranthus hypochondriacus L. đã được xác định và phân tích. Chiều dài các gene này dao động từ 729 đến 9324 nucleotide và hầu hết gene có bốn hoặc năm intron. Các protein suy diễn có chiều dài từ 226 tới 311 amino acid và mang sáu hoặc bảy xoắn xuyên màng đặc trưng. Hầu hết các protein này có tính kiềm với pI 8 08 9 73. Phân tích cây phả hệ cho phép phân chia các AhSWEET thành bốn nhóm nhóm I ba gene nhóm II bảy gene nhóm III tám gene và nhóm IV hai gene . Các gene này phân bố không đồng đều trong hệ gene của cây dền lấy hạt. Mười hiện tượng nhân gene đã được phát hiện hình thành nên các cặp gene SWEET lặp ở loài cây này trong đó chủ yếu là hiện tượng nhân gene trên toàn hệ gene. Các gene lặp trong cặp hình thành từ quá trình nhân gene chịu sự tác động của chọn lọc âm giữ ổn định trình tự nucleotide. Kết quả của nghiên cứu này là cơ sở cho các nghiên cứu xa hơn như nghiên cứu chức năng gene hoặc cải tiến di truyền. Từ khóa SWEET đặc điểm gene biểu hiện gene cây di truyền dền lấy hạt In silico characterization of genes encoding SWEET .