tailieunhanh - Nghiên cứu động lực học phân tử Reaxff của hCD38 trong dung dịch nước với một số chất ức chế

Bài viết trình bày kết quả nghiên cứu mô phỏng động lực học phân tử trong môi trường dung dịch nước của phức chất CD38 với một số chất ức chế vi mô và nano nhờ sử dụng trường lực phản ứng ReaxFF tích hợp vào SCM ADF. Việc phân tích và xử lý kết quả dựa trên tệp quỹ đạo nguyên tử .rxkf được tạo bằng ADF và được hỗ trợ bởi phần mềm bên ngoài Hbond. Mời các bạn cùng tham khảo! | KHOA HOC VÀ CÔNG NGHỆ NGHIÊN CỨU ĐỘNG LỰC HỌC PHÂN TỬ ReaxFF CỦA hCD38 TRONG DUNG DỊCH NƯỚC VỚI MỘT SỐ CHẤT ỨC CHẾ . Đặng Ứng Vận Phòng Quản lý chất lượng Trường Đại học Hòa Bình Tác giả liên hệ duvan@ Ngày nhận 26 8 2021 Ngày nhận bản sửa 01 9 2021 Ngày duyệt đăng 08 9 2021 Tóm tắt Bài viết trình bày kết quả nghiên cứu mô phỏng động lực học phân tử trong môi trường dung dịch nước của phức chất CD38 với một số chất ức chế vi mô và nano nhờ sử dụng trường lực phản ứng ReaxFF tích hợp vào SCM ADF. Việc phân tích và xử lý kết quả dựa trên tệp quỹ đạo nguyên tử .rxkf được tạo bằng ADF và được hỗ trợ bởi phần mềm bên ngoài Hbond. Kết quả cho thấy rằng trước tiên ReaxFF có thể đưa ra cấu hình tâm hoạt động của protein trong vùng có khoảng cách R 3A từ các nguyên tử của chất ức chế 41Z phù hợp với dữ liệu cấu trúc tinh thể trong khi trường lực cổ điển đánh giá quá cao số phối trí của các nguyên tử này. Thứ hai ngoài các yếu tố ảnh hưởng đến hoạt động của chất ức chế như cấu trúc hóa học nhóm chức và khả năng hình thành liên kết hydro còn có một yếu tố khác được gọi là yếu tố hình học liên quan đến mối quan hệ hình học giữa axit amin ở tâm hoạt động và phối tử chất ức chế. Cụ thể chất ức chế có hoạt tính ức chế CD38 cao hơn nếu i các nguyên tử của nó tiếp cận với nhiều axit amin tâm hoạt động hơn ii tổng tần suất gặp các nguyên tử không phải hydro của các axit amin ở khoảng cách R 3 Å với các nguyên tử chất ức chế thấp hơn và iii số lượng liên kết hydro giữa chất ức chế và axit amin cũng như H2O cao hơn. Từ khóa Động lực học phân tử trường lực phản ứng CD38 chất ức chế liên kết hydro ReaxFF molecular dynamics study on the active site configuration of hCD38 in aqueous solution with some inhibitors Abstract The paper presents molecular dynamics simulation of the aqueous solutions of CD38 complexes with some micro and nanosized inhibitors by using ReaxFF reactive force field integrated into the SCM ADF. The obtained results which were analyzed and

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.