tailieunhanh - Phân tích tương tác protein và mức độ biểu hiện giữa các yếu tố nhân y ở cây sắn (Manihot esculenta crantz.) bằng công cụ tin sinh học

Nhân tố phiên mã yếu tố nhân Y (NF-Y) tham gia vào nhiều quá trình sinh học trong sinh vật nhân chuẩn. Trong nghiên cứu này, khả năng tương tác giữa các tiểu phần NF-Y, cũng như tương quan biểu hiện của NF-Y với các nhân tố phiên mã khác được phân tích trên cây sắn (Manihot esculenta Crantz.). | BÁO CÁO KHOA HỌC VỀ NGHIÊN CỨU VÀ GIẢNG DẠY SINH HỌC Ở VIỆT NAM - HỘI NGHỊ KHOA HỌC QUỐC GIA LẦN THỨ 4 DOI PHÂN TÍCH TƯƠNG TÁC PROTEIN VÀ MỨC ĐỘ BIỂU HIỆN GIỮA CÁC YẾU TỐ NHÂN Y Ở CÂY SẮN Manihot esculenta Crantz. BẰNG CÔNG CỤ TIN SINH HỌC Lê Thị Ngọc Quỳnh Tóm tắt Nhân tố phiên mã yếu tố nhân Y NF-Y tham gia vào nhiều quá trình sinh học trong sinh vật nhân chuẩn. Nghiên cứu về tương tác protein - protein và mức độ biểu hiện gen tương quan lẫn nhau giữa NF-Y với các nhận tố phiên mã khác có ý nghĩa quan trọng trong việc dự đoán chức năng gen. Trong nghiên cứu này khả năng tương tác giữa các tiểu phần NF-Y cũng như tương quan biểu hiện của NF-Y với các nhân tố phiên mã khác được phân tích trên cây sắn Manihot esculenta Crantz. . Trong đó các dạng kết hợp tạo nên dạng tam hợp giữa các tiểu phần MeNF-Y gồm MeNF-YA9 MeNF-YB8 MeNF-YC12 MeNF-YC9 MeNF- YC8 hay MeNF-YC2. Các tương tác protein có tỷ số dự đoán cao nhất đều thuộc nhóm tương tác giữa MeNF-YB và MeNF-YC tương tự như kết quả đã được công bố trên nhiều loài thực vật khác. Khai thác dữ liệu hệ phiên mã của sắn trên nhiều mẫu mô cơ quan khác nhau đã cho thấy MeNF-YA9 có mối tương quan với gen CONSTANS 1 MeCO1 . Kết quả của nghiên cứu này đã mở ra nhiều dẫn liệu quan trọng cho các hướng nghiên cứu chức năng của MeNF-Y trong các quá trình sinh học của thực vật. Từ khóa Biểu hiện gen cây sắn nhân tố phiên mã tương tác protein yếu tố nhân Y. 1. MỞ ĐẦU Yếu tố nhân Y NF-Y đã được biết đến là protein hoạt hóa nhân heme hay yếu tố liên kết với hộp CCAAT nhân tố điều hòa phiên mã có mặt ở hầu hết các loài sinh vật nhân thực. Nhân tố điều hòa phiên mã NF-Y bảo toàn chứa 3 tiểu phần NF-YA B C Nardini et al. 2013 . Các tiểu phần này chứa trình tự đặc hiệu liên kết với yếu tố cis hộp CCAAT có mặt ở vùng promoter của sinh vật nhân thực Nardini et al. 2013 . Một tiểu phần NF-Y đơn độc không thể tham gia điều hòa phiên mã. Các tiểu phần chỉ có thể thực hiện được chức năng khi ở dạng nhị hợp hoặc tam hợp .