tailieunhanh - Nghiên cứu khả năng bảo vệ thụ thể chủ ACE2 và ức chế spike protein 6VSB của SARS-CoV-2 từ một số dẫn xuất phenylpropene bằng phương pháp mô phỏng lắp ghép phân tử

Các dẫn xuất phenylpropene gồm chavicol acetate (A1), eugenol (A2), transisoeugenol (A3) và eugenol acetate (A4) được nghiên cứu bằng mô phỏng lắp ghép phân tử với việc ức chế thụ thể ACE2 và protein gai sừng (spike protein) (6VSB) của SARS-CoV-2. Kết quả mô phỏng chỉ ra rằng protein ACE2 được ức chế bảo vệ khả năng ức chế theo thứ tự A1 > A3 > A4 > A2. So sánh với khả năng ức chế protein 6SVB nhận thấy thứ tự về khả năng ức chế thay đổi theo dãy A1 > A4 > A3 > A2. Giá trị độ lệch bình phương trung bình gốc (RMSD) trong các phức hợp nghiên | TẠP CHÍ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ Trường Đại học Khoa học ĐH Huế Tập 18 Số 2 2021 NGHIÊN CỨU KHẢ NĂNG BẢO VỆ THỤ THỂ CHỦ ACE2 VÀ ỨC CHẾ SPIKE PROTEIN 6VSB CỦA SARS-CoV-2 TỪ MỘT SỐ DẪN XUẤT PHENYLPROPENE BẰNG PHƯƠNG PHÁP MÔ PHỎNG LẮP GHÉP PHÂN TỬ Bùi Quang Thành1 Nguyễn Vĩnh Phú2 Nguyễn Hoài Bảo1 Phan Tứ Quý3 Trần Thị Ái Mỹ1 Nguyễn Thị Thanh Hải1 Nguyễn Thị Ái Nhung1 1 Khoa Hóa học Trường Đại học Khoa học Đại học Huế 2Khoa Khoa học cơ bản Trường Đại học Y Dược Đại học Huế 3 Khoa Khoa học tự nhiên Trường Đại học Tây Nguyên Email ntanhung@ Ngày nhận bài 5 3 2021 ngày hoàn thành phản biện 15 3 2020 ngày duyệt đăng 15 4 2021 TÓM TẮT Các dẫn xuất phenylpropene gồm chavicol acetate A1 eugenol A2 trans- isoeugenol A3 và eugenol acetate A4 được nghiên cứu bằng mô phỏng lắp ghép phân tử với việc ức chế thụ thể ACE2 và protein gai sừng spike protein 6VSB của SARS-CoV-2. Kết quả mô phỏng chỉ ra rằng protein ACE2 được ức chế bảo vệ khả năng ức chế theo thứ tự A1 gt A3 gt A4 gt A2. So sánh với khả năng ức chế protein 6SVB nhận thấy thứ tự về khả năng ức chế thay đổi theo dãy A1 gt A4 gt A3 gt A2. Giá trị độ lệch bình phương trung bình gốc RMSD trong các phức hợp nghiên lt 2Å khẳng định tiềm năng ức chế. Khả năng ức chế được giải thích dựa vào sự khớp hình học giữa các thành phần tham gia. Các dẫn xuất của phenylpropene được đề xuất là các hợp chất tự nhiên tiềm năng trong việc hỗ trợ quá trình tìm kiếm các dược chất trong nghiên cứu ức chế SARS-CoV-2. Từ khóa Mô phỏng lắp ghép phân tử thụ thể chủ ACE2 spike glycoprotein 6VSB phenylpropenes. 1. MỞ ĐẦU Hợp chất thiên nhiên luôn là nguồn dược chất quan trọng trong quá trình tìm kiếm thuốc mới điều trị bệnh nói chung và thuốc kháng virus gây viêm đường hô hấp cấp nói riêng. Hiện nay nhiều hướng nghiên cứu tiếp cận với kho tàng các hợp chất phân lập từ cây cỏ để tìm ra các hợp chất có hoạt tính ứng dụng trong lĩnh vực dược phẩm với hai hướng nghiên cứu được thực hiện phổ biến là 1 thực hiện sàng lọc ảo 49 Nghiên cứu khả .