tailieunhanh - Giải mã hệ gen Canine distemper virus gây bệnh trên chó năm 2018

Bệnh Carre hay còn được gọi là bệnh sài sốt ở chó là một bệnh truyền nhiễm cấp tính do Canine Distemper Virus (CDV) gây ra. Đây là một virus RNA sợi đơn âm thuộc chi Morbillivirus, họ Paramyxoviridae với đặc trưng của bệnh là sốt cấp tính, rối loạn tiêu hóa, hô hấp và rối loạn hệ thần kinh, đặc biệt bệnh có tỷ lệ chết rất cao. | Tạp chí Công nghệ Sinh học 18 3 465-475 2020 GIẢI MÃ HỆ GEN CANINE DISTEMPER VIRUS GÂY BỆNH TRÊN CHÓ NĂM 2018 Đỗ Thị Roan1 Đỗ Đức Thành3 Đặng Thị Mai Lan3 Phạm Hồng Ngọc4 Nguyễn Hữu Đức4 Nguyễn Thị Khuê1 2 Nguyễn Thị Thu Hiền1 Lê Thị Kim Xuyến1 2 Lê Thanh Hòa1 2 Đoàn Thị Thanh Hương1 2 1 Viện Công nghệ sinh học Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam 2 Học viện Khoa học và Công nghệ Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam 3 Trường Đại học Nông Lâm Thái Nguyên 4 Học viện Nông nghiệp Việt Nam Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail doantthuong74@ Ngày nhận bài Ngày nhận đăng TÓM TẮT Toàn bộ hệ gen của chủng virus gây bệnh Carre trên chó Canine Distemper Virus thu nhận tại Hà Nội năm 2018 CDVHN5 đã được giải mã và phân tích phả hệ nguồn gốc. Hệ gen của chủng CDVHN5 có độ dài nucleotide mã hóa cho hai protein không cấu trúc protein C và V và 6 protein cấu trúc gồm large protein L haemagglutinin H phosphoprotein P nucleocapsid protein N fusion protein F và matrix protein M . Trong thành phần hệ gen Adenine A chiếm tỷ lệ cao nhất gồm nucleotide 30 58 tiếp theo là Thymine T gồm nucleotide chiếm 26 62 Guanine G gồm nucleotide chiếm 21 70 và chiếm tỷ lệ thấp nhất là Cytosine C gồm nucleotide 21 10 . Tỷ lệ G C là 42 8 thấp hơn tỷ lệ A T 57 2 . Kết quả so sánh về trình tự nucleotide cho thấy chủng CDVHN5 của Việt Nam có tỷ lệ tương đồng cao nhất 99 7 với chủng virus cường độc thu nhận tại Thành phố Hồ Chí Minh năm 2014 CDV dog HCM 33 140816 thuộc genotype Asia-1. Chủng CDVHN5 có tỷ lệ tương đồng thấp so với các chủng thuộc các genotype khác 92 4 đến 96 trong đó thấp nhất với chủng virus vaccine Onderstepoort-US-2002 thuộc genotype America-1 và chủng virus CDV2784-IT-2013 thuộc genotype Arctic 92 4 . Kết quả phân tích phả hệ nguồn gốc cho thấy chủng CDVHN5 thuộc genotype Asia-1 cùng với các chủng của Trung Quốc Đài Loan Thái Lan và Hàn Quốc. Cho đến nay mới có duy nhất một hệ gen của CDV Thành phố Hồ Chí Minh