tailieunhanh - Nghiên cứu in silico tìm kiếm các chất ức chế B-cell lymphoma 2 trong điều trị bệnh ung thư

Nghiên cứu in silico nhằm tìm kiếm các chất ức chế Bcl-2 được tiến hành thực hiện với mục tiêu xây dựng mô hình 3Dpharmacophore, mô hình 2D QSAR để dự đoán hoạt tính ức chế protein Bcl-2, mô hình mô tả phân tử docking để đánh giá sự gắn kết của các chất ức chế với protein Bcl-2. | Nghiên cứu in silico tìm kiếm các chất ức chế B-cell lymphoma 2 trong điều trị bệnh ung thư Võ Thị Minh Nguyên1 Lê Minh Trí1 2 Trần Thành Đạo1 Thái Khắc Minh1 1 Khoa Dược Đại học Y Dược TP. Hồ Chí Minh 2 Khoa Y Đại học Quốc gia TP. Hồ Chí Minh Summary Bcl-2 B-cell lymphoma 2 is an anti-apoptotic protein member of the Bcl-2 family its overexpression is important for tumor cells to escape apoptosis. Therefore Bcl-2 is potential therapeutic target for new antitumor drug development. Building in silico models docking molecular descriptions 3D-Pharmacophore and 2D-QSAR based on the structure of Bcl-2 protein PDB ID 6O0K and Bcl-2 inhibitors to screen database libraries for substance targeting Bcl-2. Molecular docking results indicated that good binding ability of Bcl-2 inhibitors are into the binding grove of Bcl-2 protein. Amino acids such as Arg146 Asp111 Asp103 and two P2 P4 hydrophobic pockets are important in binding Bcl-2 inhibitors. A 5-point 3D-pharmacophore model was developed including F1 Aro PiR F2 Hyd F3 Hyd F4 Acc2 and F5 Acc2. For 250 aryl sulfonamid amids 2D QSAR model with 6 molecular descriptors was obtained with R2 RMSE . Using those models and ADME assessment on ChemDiv Maybridge Drugbank and Traditional Chinese Medicine TCM database in silico screening showed that K284-5760 8010-4956 G936-1802 KM05110 DB12138 27253 27592 were the 7 top potential structures and suggested running in other studies to evaluate the effectiveness on treatment cancer. Keywords Bcl-2 apoptosis QSAR pharmacophore docking in slilico screening. Đặt vấn đề protein ức chế apoptosis đầu tiên của họ protein Apoptosis là quá trình chết theo chương trình Bcl-2 được xác định. Nó được phát hiện lần đầu của tế bào và đóng vai trò quan trọng ở động tiên trong bệnh u lympho tế bào B do sự chuyển vật có vú trong sự phát triển cũng như cân bằng vị nhiễm sắc thể giữa nhiễm sắc thể 14 và 18 t nội mô. Nó giúp loại bỏ những tế bào không 14 18 . Sự chuyển vị nhiễm sắc thể này gây ra .