tailieunhanh - Đánh giá mối quan hệ di truyền của một số giống hồ tiêu (Piper nigrum L.) vùng Đông Nam Bộ bằng gen matK

Trong nghiên cứu này, gen matK được sử dụng để phân tích mối quan hệ di truyền của các giống hồ tiêu đang được canh tác tại vùng Đông Nam bộ, từ đó làm cơ sở cho việc đánh giá và bảo tồn nguồn gen hồ tiêu Việt Nam. | KHOA HỌC CÔNG NGHỆ ĐÁNH GIÁ MỐI QUAN HỆ DI TRUYỀN CỦA MỘT SỐ GIỐNG HỒ TIÊU Piper nigrum L. VÙNG ĐÔNG NAM BỘ BẰNG GEN MATK Đặng Thị Kim Thúy1 Võ Thị Thanh Tâm1 Đỗ Đăng Giáp1 Trần Trọng Tuấn1 Nguyễn Thị Huyền Trang1 Nguyễn Thị Dược1 Nguyễn Đức Quang2 Lê Thành Long1 TÓM TẮT Mối quan hệ di truyền của các giống hồ tiêu thuộc vùng Đông Nam bộ được đánh giá thông qua việc so sánh trình tự gen matK của các giống hồ tiêu thu thập được và các trình tự tham chiếu trên nguồn cơ sở dữ liệu NCBI. Kết quả phân tích sự biến đổi trình tự nucleotide gen matK của các giống hồ tiêu cho thấy các giống hồ tiêu Việt Nam có sự biến đổi trình tự nucleotide nhiều so với các giống hồ tiêu trên thế giới đặc biệt là giống VLDN3 và ADDN có 17 vị trí biến đổi so với nhóm hồ tiêu thế giới. Các vùng biến đổi đặc trưng quan trọng của nhóm hồ tiêu Việt Nam xảy ra ở vị trí 463 trừ mẫu giống VLDN1 chiếm tỉ lệ 85 71 trên tổng số mẫu hồ tiêu thu thập. Ở vị trí 680 sự biến đổi xuất hiện ở 4 giống hồ tiêu VLDN2 VLVT2 VLDN3 và ADDN chiếm 57 14 tổng số mẫu thu thập. Mối quan hệ phát sinh loài giữa các nhóm hồ tiêu Việt Nam cũng được phân tích và kết quả cho thấy các giống hồ tiêu nhóm VNI VLDN1 VLDN2 VLDN9 SRDN VLVT2 có mối quan hệ gần hơn so với các giống hồ tiêu thuộc nhóm VNII VLDN3 và ADDN . Mối quan hệ phát sinh loài của nhóm hồ tiêu Việt Nam và thế giới cũng được xác định khi kết quả phân tích cho thấy nhóm hồ tiêu VNI có mối quan hệ gần hơn nhóm hồ tiêu East Asia Trung Quốc Nhật Bản và Southeast Asia Thái Lan Philipin và Pakistan so với nhóm hồ tiêu VNII. Từ khóa Đông Nam bộ hồ tiêu mã vạch DNA matK quan hệ di truyền. 1. GIỚI THIỆU4 Từ năm 2003 mã vạch DNA được coi là một Cây hồ tiêu Piper nigrum L. là một loại cây công cụ phân tử và tin sinh học để phân biệt loài xác công nghiệp nhiệt đới lâu năm có nguồn gốc từ vùng định và phát hiện các loài mới ở cấp độ phân loại Tây Nam Ấn Độ. Từ đây hồ tiêu được đưa đến phân tử 4 . Trong mã vạch DNA một chuỗi DNA Indonesia Malaysia và sau đó đến các nước trồng