tailieunhanh - Điều chỉnh quy trình semi-nested RT-PCR chẩn đoán Tilapia Lake virus (TiLV) và bước đầu phân lập TiLV từ cá rô phi Việt Nam

Tilapia Lake virus là loại virus được phát hiện trên cả cá rô phi trong tự nhiên và cá rô phi nuôi. Đây là một trong những nghiên cứu đầu tiên về TiLV phân lập tại Việt Nam. Trong năm 2019 và 2020, nhóm nghiên cứu đã tiến hành thu thập 51 mẫu cá rô phi nghi ngờ nhiễm TiLV tại thành phố Hồ Chí Minh (Tp. HCM) và Vĩnh Long. | VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II ĐIỀU CHỈNH QUY TRÌNH SEMI-NESTED RT-PCR CHẨN ĐOÁN TILAPIA LAKE VIRUS TiLV VÀ BƯỚC ĐẦU PHÂN LẬP TiLV TỪ CÁ RÔ PHI VIỆT NAM Ngô Huỳnh Phương Thảo1 Trần Hạnh Triết1 Nguyễn Hoàng Thụy Vy1 Lê Thị Thu Thảo1 Bùi Nguyễn Chí Hiếu1 Trần Thị Thanh Hương1 Nguyễn Hoàng Chi Mai2 Lê Hoàng Thế Huy3 Trần Nhựt Linh4 TÓM TẮT Tilapia Lake virus là loại virus được phát hiện trên cả cá rô phi trong tự nhiên và cá rô phi nuôi. Đây là một trong những nghiên cứu đầu tiên về TiLV phân lập tại Việt Nam. Trong năm 2019 và 2020 nhóm nghiên cứu đã tiến hành thu thập 51 mẫu cá rô phi nghi ngờ nhiễm TiLV tại thành phố Hồ Chí Minh Tp. HCM và Vĩnh Long. Kết quả semi-nested RT-PCR cho thấy chỉ có 02 51 3 9 mẫu dương tính với virus TiLV các mẫu còn lại đều cho kết quả âm tính. Việc nuôi cấy virus trên dòng tế bào E-11 được thực hiện thành công trên 02 mẫu virus TiLV Việt Nam VL160 và VL167 . Tuy nhiên các mẫu virus TiLV Việt Nam chưa được duy trì thành công trên dòng tế bào E-11 qua các lần cấy chuyền và quy trình này cần phải được tối ưu thêm. Ngoài ra nghiên cứu cũng đã thay đổi quy trình semi-nested RT-PCR chẩn đoán TiLV để đạt hiệu quả khuếch đại tốt hơn so với 02 quy trình semi-nested RT-PCR cho TiLV phổ biến hiện nay bằng cách thay cặp mồi đặc hiệu bằng cặp mồi Random hexamer OligodT trong phản ứng tổng hợp cDNA. Mặc dù độ nhạy của quy trình RT-PCR tối ưu này cần được khảo sát thêm ở các nồng độ mẫu RNA khác nhau nhưng quy trình RT-PCR này có thể được ứng dụng tại các đơn vị kiểm soát dịch bệnh thủy sản để tăng hiệu quả phát hiện virus TiLV. Từ khóa Tilapia Lake virus cá rô phi phản ứng semi-nested RT-PCR tế bào E-11 I. GIỚI THIỆU thuộc họ Orthomyxoviridae do sự tương đồng Tilapia Lake virus TiLV được tìm thấy lần với các cấu trúc gen ở Orthomyxoviruses. Tuy đầu tiên trên cá rô phi nuôi vào năm 2014 tại Israel nhiên sau này TiLV được xếp vào một họ mới Eyngor et al. 2014a . Đây là loại virus RNA Amnoonviridae thuộc cùng bộ Articulavirales mạch đơn sợi âm