tailieunhanh - Detailed evaluation of cancer sequencing pipelines in different microenvironments and heterogeneity levels

In this study, we compared the performance of twelve pipelines (three mapping and four variant discovery algorithms) with recommended settings to capture single nucleotide variants. We observed significant discrepancy in variant calls among tested pipelines for different heterogeneity levels in real and simulated samples with overall high specificity and low sensitivity. Additional to the individual evaluation of pipelines, we also constructed and tested the performance of pipeline combinations. In these analyses, we observed that certain pipelines complement each other much better than others and display superior performance than individual pipelines. This suggests that adhering to a single pipeline is not optimal for cancer sequencing analysis and sample heterogeneity should be considered in algorithm optimization. |

Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN

Ebook Darwinism, philosophy, and experimental biology: Special issue of the journal for general philosophy of science
144    10    1

The influence of gender and interest on the use of learning strategies in biology lessons
11    1    1

Exploring practical pedagogy in high school biology education: A qualitative study of pre-service biology teachers’ experiences in Vietnam
15    2    1

Crosstalk between autophagy and apoptosis induced by camphor in Schizosaccharomyces pombe
9    65    1

Applications of CRISPR/Cas9-based genome editing in the plant biology
16    65    1

Flower biology of black pepper (Piper nigrum) in Vietnam
6    31    1

Doxorubicin-induced transcriptome meets interactome: identification of new drug targets
13    20    1

Determination of teacher candidates’ views concerning V diagrams used in general biology laboratories
7    1    1

The effects of biology laboratory practices supported with self-regulated learning strategies on students' self-directed learning readiness and their attitudes towards science experiments
11    1    1

South Kalimantan local wisdom based biology learning model
15    1    1
TÀI LIỆU XEM NHIỀU

Một Case Về Hematology (1)

8    462291    61

Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14    24918    79

Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13    11286    542

Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14    10511    466

Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3    9790    108

Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249    8876    1160

Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16    8467    426

Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8    8090    2279

Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152    7471    1763

Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17    7188    268
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG

THE ANTHROPOLOGY OF ONLINE COMMUNITIES BY Samuel M.Wilson and Leighton C. Peterson
19    211    4    26-11-2024

Báo cáo nghiên cứu khoa học " HÃY LÀM CHO HUẾ XANH HƠN VÀ ĐẸP HƠN "
6    167    3    26-11-2024

Báo cáo nghiên cứu khoa học " Đại hội XVI thông qua điều lệ Đảng cộng sản Trung Quốc những sửa đổi bổ sung mới "
4    155    1    26-11-2024

The Ombudsman Enterprise and Administrative Justice
309    132    0    26-11-2024

đề cương ôn tập chương Vật lý 10 - Cơ học
6    120    0    26-11-2024

Báo cáo nghiên cứu nông nghiệp " KẾ HOẠCH THỐNG NHẤT GIỮA SẢN XUẤT, PHÂN PHỐI VÀ GIỚI THIỆU SẢN PHẨM CÂY DƯA CHUỘT CẢI BẮP "
3    114    1    26-11-2024

5 lý do khiến phụ nữ không thể giảm cân
6    136    0    26-11-2024

Giáo trình điều dưỡng khoa ngoại part 7
22    147    2    26-11-2024

Sprint Mobile SyncUser Guide phần 2
13    94    0    26-11-2024

Lợi ích sức khỏe từ một số loại gia vị cay
5    124    0    26-11-2024
TÀI LIỆU HOT

Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8    8090    2279

Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152    7471    1763

Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112    4364    1369

Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62    6156    1258

Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249    8876    1160

Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561    3790    680

Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122    3909    609

Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274    4618    562

Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13    11286    542

Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35    4454    490