Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Khoa Học Tự Nhiên
Địa Lý
Adaptive large neighborhood search enhances global protein protein network alignment
Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Adaptive large neighborhood search enhances global protein protein network alignment
Mỹ Anh
51
11
pdf
Đang chuẩn bị nút TẢI XUỐNG, xin hãy chờ
Tải xuống
In this paper, we present a novel global protein-protein interaction network alignment algorithm, which is enhanced with an extended large neighborhood search heuristics. Evaluated on benchmark datasets of yeast, fly, human and worm, the proposed algorithm outperforms state-of-the-art algorithms. Furthermore, the complexity of ours is polynomial, thus being scalable to large biological networks in practice. | VNU Journal of Science Comp. Science amp Com. Eng. Vol. 35 No. 1 2019 46-55 Original Article Adaptive Large Neighborhood Search Enhances Global Protein-Protein Network Alignment Vu Thi Ngoc Anh1 2 Nguyen Trong Dong2 Nguyen Vu Hoang Vuong2 Dang Thanh Hai3 Do Duc Dong3 1 The Hanoi college of Industrial Economics 2 VNU University of Engineering and Technology 144 Xuan Thuy Cau Giay Hanoi Vietnam 3 Bingo Biomedical Informatics Laboratory Bingo Lab Faculty of Information Technology VNU University of Engineering and Technology Received 05 March 2018 Revised 19 May 2019 Accepted 27 May 2019 Abstract Aligning protein-protein interaction networks from different species is a useful mechanism for figuring out orthologous proteins predicting verifying protein unknown functions or constructing evolutionary relationships. The network alignment problem is proved to be NP-hard requiring exponential-time algorithms which is not feasible for the fast growth of biological data. In this paper we present a novel global protein-protein interaction network alignment algorithm which is enhanced with an extended large neighborhood search heuristics. Evaluated on benchmark datasets of yeast fly human and worm the proposed algorithm outperforms state-of-the-art algorithms. Furthermore the complexity of ours is polynomial thus being scalable to large biological networks in practice. Keywords Heuristic Protein-protein interaction networks network alignment neighborhood search. 1. Introduction From biological perspectives a good alignment between protein-protein networks Advanced high-throughput biotechnologies PPI in different species could provide a strong have been revealing numerous interactions evidence for i predicting unknown functions between proteins at large-scales for various of orthologous proteins in a less-well studied species. Analyzing those networks is thus species or ii verifying those with known becoming emerged such as network topology functions 5 or iii detecting common .
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
An adaptive large neighborhood search heuristic for solving the reliable multiple allocation hub location problem under hub disruptions
Online Adaptive Neuro-Fuzzy inference based SVC control strategy for stability enhancement in two machine power system
In vitro root architectural screening for early drought adaptive traits in sorghum (Sorghum bicolor L.)
Adaptive probabilistic tracking with visual saliency selection reliable particles
Báo cáo sinh học: " Research Article Adaptive Long-Term Coding of LSF Parameters Trajectories for Large-Delay/Very- to Ultra-Low Bit-Rate Speech Coding"
Switched Systems
Báo cáo hóa học: " Adaptive antenna selection and Tx/Rx beamforming for large-scale MIMO systems in 60 GHz channels"
Parameter estimation in large-scale systems biology models: A parallel and self-adaptive cooperative strategy
Adaptive large neighborhood search enhances global protein protein network alignment
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.