Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Khoa Học Tự Nhiên
Sinh học
K-shell decomposition reveals structural properties of the gene coexpression network for neurodevelopment
Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
K-shell decomposition reveals structural properties of the gene coexpression network for neurodevelopment
Phương Hạnh
60
9
pdf
Đang chuẩn bị nút TẢI XUỐNG, xin hãy chờ
Tải xuống
Neurodevelopment is a dynamic and complex process, which involves interactions of thousands of genes. Understanding the mechanisms of brain development is important for uncovering the genetic architectures of neurodevelopmental disorders such as autism spectrum disorder and intellectual disability. | Turkish Journal of Biology http://journals.tubitak.gov.tr/biology/ Research Article Turk J Biol (2017) 41: 333-341 © TÜBİTAK doi:10.3906/biy-1608-30 k-Shell decomposition reveals structural properties of the gene coexpression network for neurodevelopment 1,2, A. Ercüment ÇİÇEK * Department of Computer Engineering, Faculty of Engineering, Bilkent University, Ankara, Turkey 2 Department of Computational Biology, School of Computer Science, Carnegie Mellon University, Pittsburgh, PA, USA 1 Received: 10.08.2016 Accepted/Published Online: 18.12.2016 Final Version: 20.04.2017 Abstract: Neurodevelopment is a dynamic and complex process, which involves interactions of thousands of genes. Understanding the mechanisms of brain development is important for uncovering the genetic architectures of neurodevelopmental disorders such as autism spectrum disorder and intellectual disability. The BrainSpan dataset is an important resource for studying the transcriptional mechanisms governing neurodevelopment. It contains RNA-seq and microarray data for 13 developmental periods in 8–16 brain regions. Various important studies used this dataset, in particular to generate gene coexpression networks. The topology of the BrainSpan gene coexpression network yielded various important gene clusters, which are found to play key roles in diseases. In this work, we analyze the topology of the BrainSpan gene coexpression network using the k-shell decomposition method. k-Shell decomposition is an unsupervised method to decompose a network into layers (shells) using the connectivity information and to detect a nucleus that is central to overall connectivity. Our results show that there are 267 layers in the BrainSpan gene coexpression network. The nucleus contains 2584 genes, which are related to chromatin modification function. We compared and contrasted the structure with the autonomous system level Internet. We found that despite similarities in percolation transition and crust size .
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.