Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Khoa Học Tự Nhiên
Sinh học
Computational approach for selection of epitope-based dengue vaccine targets
Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Computational approach for selection of epitope-based dengue vaccine targets
Phúc Lâm
93
14
pdf
Đang chuẩn bị nút TẢI XUỐNG, xin hãy chờ
Tải xuống
In this study, a computational approach was utilized to identify and analyze highly conserved amino acid sequences of the DENV E protein. Sequences of 9 amino acids or more were specifically focused due to their immune-relevant as T-cell determinants. Different bioinformatics tools were responsible for revealing conserved regions in the DENV E protein and constructing the phylogenetic tree from the sequence database. The tools also predicted immunogenicity of the identified vaccine targets. Ultimately, two peptide regions of at least 9 amino acids were chosen due to their high conserved attribute in more than 95% of all collected DENV sequences. | Journal of Biotechnology 14(4): 605-618, 2016 COMPUTATIONAL APPROACH FOR SELECTION OF EPITOPE-BASED DENGUE VACCINE TARGETS Phuc Nguyen1, Ly Le1, 2, * 1 2 International University, Vietnam National University Ho Chi Minh City Ho Chi Minh Institute for Computational Science and Technology * To whom correspondence should be addressed. E-mail: ly.le@hcmiu.edu.vn Received: 11.9.2016 Accepted: 28.12.2016 SUMMARY High antigenic variability in the envelope (E) protein of different virus strains has been a major obstacle in designing effective vaccines for Dengue virus (DENV). To maintain their biological function, some parts of viral proteins remain stable during evolution thus one possible approach to solve this problem is to recognize specific regions within different protein sequences of E that have the tendency to stay constant through evolution. These regions may possess some special attributes to become a vaccine candidate against dengue virus. In this study, a computational approach was utilized to identify and analyze highly conserved amino acid sequences of the DENV E protein. Sequences of 9 amino acids or more were specifically focused due to their immune-relevant as T-cell determinants. Different bioinformatics tools were responsible for revealing conserved regions in the DENV E protein and constructing the phylogenetic tree from the sequence database. The tools also predicted immunogenicity of the identified vaccine targets. Ultimately, two peptide regions of at least 9 amino acids were chosen due to their high conserved attribute in more than 95% of all collected DENV sequences. Moreover, both of them was found to be immune-relevant by their correspondence to known or putative HLA-restricted T cell determinants. The conserved attribute of these sequences through the entire analysis of this study supports their potential as candidates for further in vitro experiments for rational design a universal vaccine which has longer and broader impact. Keywords: .
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Computational approach for selection of epitope-based dengue vaccine targets
Computational complexity: A modern approach - Part 1
Báo cáo khoa học: "A Computational Approach to the Automation of Creative Naming"
Báo cáo khoa học: "A Computational Approach to Zero-pronouns in Spanish"
Báo cáo khoa học: "Multilingual Computational Semantic Lexicons in Action: The WYSINNWYG Approach to NLP"
Ebook Computational network science - An algorithmic approach: Part 1
Ebook Computational network science - An algorithmic approach: Part 2
Computational complexity: A modern approach - Part 2
Understanding the liver under heat stress with statistical learning: An integrated metabolomics and transcriptomics computational approach
Wall modeling les approach on smooth wall from low to high reynolds numbers
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.