tailieunhanh - Phương pháp lấy mẫu thuộc tính mới trong rừng ngẫu nhiên cho phân tích dữ liệu SNP

Trong bài báo này đề xuất một phương pháp lấy mẫu hai bước để lựa chọn các đặc trưng có ý nghĩa trong việc huấn luyện mô hình rừng ngẫu nhiên. Phương pháp này cho phép chọn ra một tập nhỏ các đặc trưng có liên hệ chặt chẽ với biến đích (bệnh), do đó làm giảm số chiều và có thể xử lý tốt trên các tập dữ liệu có số chiều cao. Mời bạn đọc tham khảo. | J. Sci. Devel. 2015 Vol. 13 No. 2 301-307 Tạp chí Khoa học và Phát triển 2015 tập 13 số 2 301-307 PHƯƠNG PHÁP LẤY MẪU THUỘC TÍNH MỚI TRONG RỪNG NGẪU NHIÊN CHO PHÂN TÍCH DỮ LIỆU SNP Nguyễn Văn Hoàng Phan Thị Thu Hồng Nguyễn Thanh Tùng Nguyễn Thị Thủy Khoa Công nghệ thông tin Học viện Nông nghiệp Việt Nam Email nvhoang@ Ngày gửi bài Ngày chấp nhận TÓM TẮT Gần đây các nghiên cứu liên kết mức toàn hệ gen GWAS đã đạt được thành công trong việc xác định một số biến thể di truyền có ảnh hưởng tương đối lớn tới một số bệnh phức tạp. Hầu hết các GWAS sử dụng các tiếp cận đơn SNP đa hình đơn nucleotide chỉ tập trung vào việc đánh giá sự liên hệ giữa từng SNP riêng biệt với bệnh. Tuy nhiên trên thực tế các bệnh phức tạp được cho là liên quan tới những nguyên nhân phức tạp bao gồm những tương tác rắc rối giữa nhiều SNPs. Do đó cần có những cách tiếp cận khác để xác định sự ảnh hưởng của các SNP hoặc những tương tác phức tạp của các SNP tới bệnh. Phương pháp rừng ngẫu nhiên Random Forest RF gần đây đã được ứng dụng thành công trong GWAS cho việc xác định một số nhân tố di truyền có ảnh hưởng lớn tới một số bệnh phức tạp. Mặc dù RF xử lý tốt trên khía cạnh chính xác dự đoán trên một số tập dữ liệu có kích cỡ trung bình nhưng mô hình RF truyền thống có nhiều hạn chế trong việc xác định các SNPs có ý nghĩa và xây dựng các mô hình dự đoán chính xác. Trong bài báo này chúng tôi đề xuất một phương pháp lấy mẫu hai bước để lựa chọn các đặc trưng có ý nghĩa trong việc huấn luyện mô hình rừng ngẫu nhiên. Phương pháp này cho phép chọn ra một tập nhỏ các đặc trưng có liên hệ chặt chẽ với biến đích bệnh do đó làm giảm số chiều và có thể xử lý tốt trên các tập dữ liệu có số chiều cao. Chúng tôi cũng tiến hành các thực nghiệm trên hai tập dữ liệu chuẩn SNP ở mức toàn bộ hệ gen để làm sáng tỏ hiệu quả của phương pháp đề xuất. Từ khóa Genome-wide Association Study học máy khai phá dữ liệu rừng ngẫu nhiên A New Feature Sampling Method in Learning

• Lâm nghiệp
• Phân tích dữ liệu SNP
• Genome wide Association Study
• Khai phá dữ liệu
• Rừng ngẫu nhiên
• Dữ liệu SNP
• Phương pháp lấy mẫu
• Cách lấy mẫu
• Kỹ thuật lấy mẫu
• Khung lấy mẫu
• Các kỹ thuật lấy mẫu
• Bí quyết lấy mẫu
• Phương pháp lấy mẫu nước
• Mẫu tổ hợp
• Thiết bị lấy mẫu
• Bảo quản mẫu
• Bình chứa mẫu
• Thực hành lấy mẫu
• Bài giảng Phương pháp nghiên cứu khoa học
• Phương pháp nghiên cứu khoa học
• Phương pháp lấy mẫu xác suất
• Sơ đồ lấy mẫu xác suất
• Danh sách dân số
• Phát triển phương pháp lấy mẫu thụ động POCIS
• Phương pháp lấy mẫu thụ động POCIS
• Hợp chất bảo vệ thực vật phân cực
• Nước bề mặt
• Nồng độ dư lượng
• Bài giảng Phân tích thực phẩm
• Phân tích thực phẩm
• Phương pháp lấy mẫu thực phẩm
• Mẫu thử trung bình
• Lô hàng đồng nhất
• Tiêu chuẩn lấy mẫu
• Bài giảng Thống kê và phân tích dữ liệu
• Thống kê dữ liệu
• Phân tích dữ liệu
• Phân phối mẫu
• Lấy mẫu ngẫu nhiên đơn giản
• Phương pháp định lượng chính sách
• Phương pháp phân tích định lượng
• Bài giảng Phương pháp phân tích định lượng
• Chính sách công
• Phương pháp polynomial chaos
• Hệ thống treo trên ô tô
• Phương pháp PC
• Phương pháp Monte Carlo
• Chuẩn mực kiểm toán
• Hệ thống chuẩn mực kiểm toán Việt Nam
• Lấy mẫu kiểm toán
• Chuẩn mực kiểm toán số 530
• Phương pháp lấy mẫu kiểm toán
• Lựa chọn mẫu kiểm toán
• Bài giảng Kiểm toán
• Kiểm toán
• Quy trình lấy mẫu kiểm toán
• Phương pháp chọn mẫu phi thống kê
• Dự tính sai phạm
• Kỹ thuật lấy mẫu phi xác suất
• Thiết kế mẫu
• Phương pháp chọn mẫu
• Bài giảng kinh tế học
• Tài liệu kinh tế học
• Mẫu sinh thiết thận
• Phương pháp lấy mẫu sinh thiết thận
• Bệnh ở thận
• Thận bình thường
• Đặc điểm thận ghép
• Mẫu sinh thiết thận ghéo
• Tiêu chuẩn Việt Nam
• Tiêu chuẩn Quốc gia
• Sản phẩm dầu mỏ
• Tiêu chuẩn dầu mỏ
• Phương pháp lấy mẫu dầu mỏ
• Lấy mẫu dầu mỏ
• Lấy mẫu thủ công dầu mỏ
• Lấy mẫu cà phê nhân
• Cà phê nhân
• Quy trình lấy mẫu cà phê nhân
• Phương pháp lấy mẫu cà phê nhân
• Áp dụng lấy mẫu Gibbs
• Lấy mẫu Gibbs
• Phương pháp hợp lí cực đại biên (MML)
• Mô hình Rasch
• Ước lượng độ khó câu hỏi
• Phương pháp nghiên cứu trong kinh doanh
• Nghiên cứu trong kinh doanh
• Phương pháp nghiên cứu
• Lấy mẫu nghiên cứu
• Xác định cỡ mẫu
• Luận văn Toán học
• Lý thuyết xác suất
• Thống kê toán học
• Xử lý mẫu
• Luận văn Thạc sĩ
• Xét nghiệm vi sinh lâm sàng
• Tài liệu vi sinh lâm sàng
• Kỹ thuật vi sinh lâm sàng
• Vi sinh lâm sàng
• Vật liệu lấy mẫu
• Phương pháp lấy bệnh phẩm
• Chuyển bệnh phẩm
• Mức lọc cầu thận
• Xạ hình chức năng thận
• Phương pháp lấy mẫu máu
• Dược chất phóng xạ
• Y học hạt nhân
• mẫu nước uống
• tiêu chuẩn nước uống
• tiêu chuẩn chất lượng
• kiểm tra chất lượng
• quản lý sản xuất
• kinh doanh
• tiếp thị
• quản trị kinh doanh
• quản trị sản xuất
• Kỹ Thuật
• Công Nghệ
• Cơ khí
• Chế tạo máy
• Kiểm tra bằng phương pháp lấy mẫu
• chất lượng không khí
• hóa học môi trường
• ô nhiễm không khí
• phân tích môi trường
• phương pháp lấy mẫu trong nghiên cứu
• phân tích chất độc hại
• Tiêu chuẩn Việt Nam TCVN 66052007
• TCVN 66052007
• Cà phê hòa tan
• Phương pháp lấy mẫu bao gói cà phê
• Phương pháp lấy mẫu cà phê
• Tiêu chuẩn Việt Nam TCVN 44412009
• TCVN 44412009
• Phương pháp lấy mẫu ngẫu nhiên
• TCVN 4441 1987