tailieunhanh - Kết hợp mô phỏng phân mảnh peptit và khối phổ nhiều lần MSn xác định cấu trúc bậc 1 của Interleukin Interleukin 2

Trong báo cáo này, kết quả xác định trật tự amino axit của một đoạn polypeptit của IL2 bằng cách kết hợp mô phỏng phân mảnh peptit v à thực nghiệm MSn đư ợc trình b ày nh ư là những kết quả tiếp sau công bố theo h ướng nghiên cứu cấu trúc polypeptit, nh ưng định hư ớng chính và o kết hợp Hoá Sinh Tin. Bà i toán cấu trúc cụ thể l à khẳng định trật tự aa của một phân đoạn polypeptit khi đã biết trư ớc nó là một phần của IL-2. Mô phỏng phân mảnh có vai trò giúp định h ướng v à lý giải kết quả thực nghiệm MS, nhất là MSn. | Tạp chí Hóa học T. 45 6A Tr. 43 - 48 2007 KỂT HỢP MỒ PHỎNG PHÂN MẢNH PEPTIT VÀ KHỐI PHổ NHIỀU LẦN MSN XÁC ĐỊNH CÂU TRÚC BẬC 1 CỦA INTERLEUKIN 2 Đến Tòa soạn 15-11-2007 BÙI TIẾN DŨNG NGÔ VÃN QUANG NGUyỄN TIÊN TÀI Viện Hóa học Viện Khoa học vá Công nghệ Việt Nam SUMMARy lnterleukin-2 or IL-2 is a natural occurring protein in our immune system made by body for controlling the growth and functions of many types of cells. The partial amino acids aa sequences of lL-2 was determined by a combination of simulation by the Fragment lon Calculator and MS experiment in ESl iontrap and tandem MSn modes. I - GIỚI THIỆU Interleukin-2 thường ký hiệu là IL-2 cùng với các interleukin khác như IL-4 IL-7 IL-9 IL-15 và IL-21 gọi chung là họ interleukin hay cytokine là những protein có vai trò quan trọng trong hệ thống miễn dịch của cơ thể người. Cơ chế miễn dịch với sự tham gia của IL-2 và các tế bào T tương đố i phức tạp nhưng đã được làm sáng tỏ. Chính vì vậy nhất là trong giai đoạn hiện nay khi HIV trở thành đại dịch đố i với nhân loại IL-2 được đặc biệt quan tâm nghiên cứu từ chức năng trong cơ chế miễn dịch tới vai trò cụ thể của nó trong điều trị một số bệnh hiểm nghèo như ung thư hay HIV 1 2 . Về mặt cấu trúc IL-2 là một protein kích thước nhỏ trong cơ thể thường được gắn liền với các yếu tố khác của hệ thống miễn dịch receptors tạo nên những biến thể khác nhau. Hình 1 là cấu trúc bậc 1 trật tự aa của GalNAc-derivative IL-2 ký hiệu là Aff-IL-2 một dạng liên kết của IL-2 với các cột kháng thể. Đoạn protein tương đối đặc trưng cho IL-2 này gồm 133 aa trong đó có đủ mặt cả 20 loại aa cơ bản của cơ thể sống với 1 cầu sunphit nối 2 vị trí 58 và 105. Để nghiên cứu cấu trúc protein nói chung IL-2 nói riêng có thể kết tinh protein rồi đo phổ XRD hoặc là sử dụng công cụ NMR với các mẫu protein đã đồng vị hóa theo 13C và 15N 4 . Ngoài 2 phương pháp truyền thống đòi hỏi công cụ XRD và NMR hiện đại nêu trên người ta cũng có thể xác định cấu trúc của protein bằng cách sử dụng các phản ứng .