Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo khoa học: Prediction of missing enzyme genes in a bacterial metabolic network Reconstruction of the lysine-degradation pathway ofPseudomonas aeruginosa
tailieunhanh - Báo cáo khoa học: Prediction of missing enzyme genes in a bacterial metabolic network Reconstruction of the lysine-degradation pathway ofPseudomonas aeruginosa
The metabolic network is an important biological network which consists of enzymes and chemical compounds. However, a large number of meta-bolic pathways remains unknown, and most organism-specific metabolic pathways contain many missing enzymes. We present a novel method to identify the genes coding for missing enzymes using available genomic and chemical information from bacterial genomes. | ễFEBS Journal Prediction of missing enzyme genes in a bacterial metabolic network Reconstruction of the lysine-degradation pathway of Pseudomonas aeruginosa Yoshihiro Yamanishi1 Hisaaki Mihara2 Motoharu Osaki2 Hisashi Muramatsu3 Nobuyoshi Esaki2 Tetsuya Sato1 Yoshiyuki Hizukuri1 Susumu Goto1 and Minoru Kanehisa1 1 Bioinformatics Center Institute for ChemicalResearch Kyoto University Japan 2 Division of EnvironmentalChemistry Institute for ChemicalResearch Kyoto University Japan 3 Department of Biology Graduate Schoolof Science Osaka University Japan Keywords kernel methods lysine degradation pathway metabolic network missing enzymes network inference Correspondence Y. Yamanishi Bioinformatics Center Institute for Chemical Research Kyoto University Gokasho Uji Kyoto 611-0011 Japan Fax 81 774 38 3269 Tel 81 774 38 3270 E-mail yoshi@ Received 6 December 2006 revised 17 February 2007 accepted 1 March 2007 doi The metabolic network is an important biological network which consists of enzymes and chemical compounds. However a large number of metabolic pathways remains unknown and most organism-specific metabolic pathways contain many missing enzymes. We present a novel method to identify the genes coding for missing enzymes using available genomic and chemical information from bacterial genomes. The proposed method consists of two steps a estimation of the functional association between the genes with respect to chromosomal proximity and evolutionary association using supervised network inference and b selection of gene candidates for missing enzymes based on the original candidate score and the chemical reaction information encoded in the EC number. We applied the proposed methods to infer the metabolic network for the bacteria Pseudomonas aeruginosa from two genomic datasets gene position and phylogenetic profiles. Next we predicted several missing enzyme genes to reconstruct the lysinedegradation pathway in P. .
Tuấn Tú
94
12
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461867
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22643
59
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10892
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10066
446
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9519
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8281
1125
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8238
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7864
2220
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6687
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5770
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Report medicine
traditional medicine
scientific reports
genetics
Structural biochemistry
Structural Biology
biology
biological research
applied biology
modern biology
biological engineering research
metazoan systems
Biochemistry cell and molecular biology test
Molecular Biology Test
Biochemistry Test
Genetics test
Cupramolecular complexes
Campbell biology
Biology systems
Lecture Biology
Biological sciences
Molecular basis of inheritance
Structural model of DNA
scientific research
molecular Biology
structural information
breast cancer
BMC Bioinformatics
Structural systems biology
Oxidative stress
Structural proteome
Physicochemical properties
Oxidative damage
Metabolic model
BMC Molecular and Cell Biology
HIV 2 protease
Drug resistance mutations
Structural asymmetry
Structural alphabet
Structural variation
Structural mutation
450 kb duplications
Kidney cells
Genome Biology
Complex structural rearrangements
Sequence analysis
Copy number variant
Tạp chí khoa học
Structural basis of light energy
Electron transfer in biology
Models for energy and electron transfer
Electron transfer in biological materials
The blue multi copper
Biological organization
Systems biology
Structural bioinformatics
Integrative systems biology
Bioinformatics methods
Mass spectrometry
medical reports
thesis report
health education
medical report
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
extremetech Hacking Firefox phần 7
46
187
0
27-04-2024
Đóng mới oto 8 chỗ ngồi part 9
10
116
0
27-04-2024
Đề tài: Tìm hiểu một số yêu cầu đặt ra với một phòng thu âm, để đảm bảo chất lượng âm thanh trong sản phẩm đa phương tiện
8
160
1
27-04-2024
Báo cáo tốt nghiệp: Vận hành và bảo dưỡng trong MPLS
92
144
3
27-04-2024
Báo cáo nghiên cứu khoa học " HÃY LÀM CHO HUẾ XANH HƠN VÀ ĐẸP HƠN "
6
117
0
27-04-2024
Norton ghost : Chương trình sao chép ổ cứng part 9
8
101
0
27-04-2024
Giáo trình báo chí điều tra part 4
44
99
0
27-04-2024
Thủ thuật Windows : Kết nối mạng và gửi Fax part 10
10
95
0
27-04-2024
Sử dụng mô hình ARCH và GARCH để phân tích và dự báo về giá cổ phiếu trên thị trường chứng khoán
24
1022
0
27-04-2024
Donald và bạn hữu 25
32
88
0
27-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7864
2220
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5737
1368
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3767
1231
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5319
1136
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8281
1125
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3499
643
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10892
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3684
525
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4046
515
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4128
480
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.