tailieunhanh - báo cáo khoa học: "Characterization and development of EST-derived SSR markers in cultivated sweetpotato (Ipomoea batatas)"

Tuyển tập báo cáo các nghiên cứu khoa học quốc tế ngành y học dành cho các bạn tham khảo đề tài: Characterization and development of EST-derived SSR markers in cultivated sweetpotato (Ipomoea batatas) | Wang et al. BMC Plant Biology 2011 11 139 http 1471 -2229 11 139 BMC Plant Biology RESEARCH ARTICLE Open Access Characterization and development of EST-derived SSR markers in cultivated sweetpotato Ipomoea batatas 1 2 1 1 1 1 1 1 Zhangying Wang Jun Li Zhongxia Luo Lifei Huang Xinliang Chen Boping Fang Yujun Li Jingyi Chen and Xiongjian Zhang1 Abstract Background Currently there exists a limited availability of genetic marker resources in sweetpotato Ipomoea batatas which is hindering genetic research in this species. It is necessary to develop more molecular markers for potential use in sweetpotato genetic research. With the newly developed next generation sequencing technology large amount of transcribed sequences of sweetpotato have been generated and are available for identifying SSR markers by data mining. Results In this study we investigated 181 615 ESTs for the identification and development of SSR markers. In total 8 294 SSRs were identified from 7 163 SSR-containing unique ESTs. On an average one SSR was found per kb of EST sequence with tri-nucleotide motifs being the most abundant followed by di- tetra- penta- and hexa-nucleotide repeat types. The top five motifs included AG CT AAG CTT AT TA CCG CGG and AAT ATT . After removing possible duplicate of published EST-SSRs of sweetpotato a total of non-repeat 7 958 SSR motifs were identified. Based on these SSR-containing sequences 1 060 pairs of high-quality SSR primers were designed and used for validation of the amplification and assessment of the polymorphism between two parents of one mapping population E Shu 3 Hao and Guang 2k-30 and eight accessions of cultivated sweetpotatoes. The results showed that 816 primer pairs could yield reproducible and strong amplification products of which 195 and 342 primer pairs exhibited polymorphism between E Shu 3 Hao and Guang 2k-30 and among the 8 cultivated sweetpotatoes respectively. .

Uyên Thơ 67 9 pdf

Upload

Bấm vào đây để xem trước nội dung

Tải xuống

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

Báo cáo khoa học: " Áp dụng thủ tục phân tích trong kiểm toán báo cáo tài chính"

8 258 1

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Người lính trở về sau chiến tranh với mặc cảm “ăn mày dĩ vãng’ trong tiểu thuyết Chu Lai"

8 302 1

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Khảo sát hiện tượng chuyển đổi chức năng - nghĩa của động từ tiếng Việt"

8 235 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Tính năng động nghệ thuật của văn học hiện đại Việt Nam và một cách nhìn hành trình thể loại"

10 208 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: " Dẫn liệu cập nhật về thành phần loài cây họ đậu (Fabaceae) tại Vườn Quốc gia Bạch Mã - Thừa Thiên Huế "

6 206 1

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Một số kết quả của việc bổ sung bột sắn vào khẩu phần ăn và khả năng tiêu hóa thức ăn, hiệu quả chăn nuôi ở bò Laisind"

8 238 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Nghiên cứu mật độ và thành phần thức ăn của một số loài ếch nhái trên đồng ruộng Sầm Sơn - Thanh Hoá"

6 210 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: "Một số phép toán trên hệ biểu diễn tri thức dựa theo triết lý tập thô.."

7 212 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: " Liên hệ giữa không gian metric mờ với không gian Menger và không gian metric xác suất"

10 211 0

Báo cáo nghiên cứu khoa học: " BẢN CHẤT KHOA HỌC VÀ CÁCH MẠNG LÀ CỘI NGUỒN SỨC SỐNG CỦA CHỦ NGHĨA MÁC - LÊNIN"

5 301 2

TÀI LIỆU XEM NHIỀU

Một Case Về Hematology (1)

8 461857 55

Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở

14 22593 58

Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh

13 10882 529

Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học

14 10047 445

Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”

3 9513 104

Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)

249 8267 1124

Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức

16 8216 423

Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB

8 7862 2220

Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ

17 6669 253

Vật lý hạt cơ bản (1)

29 5765 85

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG

Báo cáo khoa học: Loss of kinase activity in Mycobacterium tuberculosis multidomain protein Rv1364c

14 235 0 24-04-2024

BeginningMac OS X Tiger Dashboard Widget Development 2006 phần 2

34 208 0 24-04-2024

Bài Tiểu Luận Chuyên Đề Tổ Chức Hoạt Động Nhận Thức Trong Dạy Học Vật Lý " Định Luật Ôm Cho Các Loại Đoạn Mạch Chứa Nguồn Điện"

10 150 3 24-04-2024

Giáo trình kỹ thuật sữa chữa ô tô, máy nổ part 8

47 137 1 24-04-2024

Truyện kiếm hiệp - Duy ngã độc tôn phần 5/7

1 91 0 24-04-2024

Loading Data into a Database - 19

40 97 0 24-04-2024

Phương pháp trăc nghiệm 7

6 90 0 24-04-2024

báo cáo hóa học:" A decade of modelling research yields considerable evidence for the importance of concurrency: a response to Sawers and Stillwaggon"

7 82 0 24-04-2024

CHƯƠNG 2: RỦI RO THÂM HỤT TÀI KHÓA

28 111 0 24-04-2024

Giáo trình báo chí điều tra part 4

44 99 0 24-04-2024

TÀI LIỆU HOT

Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB

8 7862 2220

Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)

152 5674 1348

Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng

112 3757 1230

Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1

62 5307 1135

Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)

249 8267 1124

Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu

561 3483 641

Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh

13 10882 529

Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân

122 3677 525

Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm

274 4039 514

Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe

35 4120 480