tailieunhanh - Tin học ứng dụng trong ngành nông nghiệp part 9

Tham khảo tài liệu 'tin học ứng dụng trong ngành nông nghiệp part 9', khoa học tự nhiên, nông - lâm phục vụ nhu cầu học tập, nghiên cứu và làm việc hiệu quả | Hình VL7. Các bước phân tích phát hiện gene b. Bản đồ gene so sánh Số lượng gene được thiết lập trên bản đồ di tru yen của các loài gia súc ít hơn nhiều so với hệ gene người. Sử dụng bản đồ gene so sánh giúp tìm ra những đoạn NST của các loài gia súc tương ứng với đoạn NST người và xem các gene trong vùng này như các ứng cử viên bờí vì gene người và các loài động vật có vú được bảo tồn ít nhất 98 . Một số phương pháp xây dựng bản đổ gene so sánh như Lai phóng xạ Radiation Hybirdisation hoặc nhuộm nhiễm sắc thể Chromosome Painting . Ta không cần thực hiện các nghiên cứu có thể dễ dàng tìm kiếm để sử dựng các kết quả được công bô trên mạng Internet xem bảng các cơ sở dữ liệu hệ gene động vật . c. Lựa chọn các gene ứng cử viên Sau khi định vị được đoạn nhiễm sắc thể người liệt kê tất cả những gene trong đoạn NST này từ các hệ thống cơ sở dữ liệu của dự án bản đồ gene người tại http hoặc http . Lựa chọn trong danh sách các gene ứng cử viên tiềm năng nhất. Tìm kiếm tài liệu tham khảo các gene trong danh sách ứng cử viên từ các trang web này bằng các từ khoá như trao đổi chất mỡ nếu nhóm những gene ảnh 408 hưởng hàm lượng mỡ sữa. Chọn các gene ứng cử viên có tài liêu tham khảo có các từ khóa này. Hơn nữa tìm các gene thành viên từ hệ thống dữ liệu hệ gene chuột http . Là một gene ứng cử viên tốt nếu những ảnh hưởng của sự biểu hiện gene ngầm phù hợp với mô hình của những ảnh hưởng QTL. Bước tiếp theo là giải mã gene ứng cử viên sau khi đã chọn. Bất kỳ sự khác nhau đối vói các nucleotie đơn SNPs gây thay đổi protein chảng hạn sự thay thê axít amin hay chèn codon dừng có thể được đánh giá như sự đột biến trong quần thể. lìm kiếm bằng BLAST để xác định nếu SNP là đột biến chức năng thay đổi protein hay đột biến ngầm không thay đổi protein . Chẳng hạn một SNP do đột biến gây ra nếu trong nhiều quần thể tất cả con vật dị hợp cho QTL cũng dị hợp đối với SNP. Ví dụ khám phá gene inverdale ở cừu Giữa năm 2000 trung tâm .