Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học: "A new, fast algorithm for detecting protein coevolution using maximum compatible cliques"
tailieunhanh - Báo cáo sinh học: "A new, fast algorithm for detecting protein coevolution using maximum compatible cliques"
Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về sinh học được đăng trên tạp chí y học Molecular Biology cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành sinh học đề tài: A new, fast algorithm for detecting protein coevolution using maximum compatible cliques. | Rodionov et al. Algorithms for Molecular Biology 2011 6 17 http content 6 1 17 AMR ALGORITHMS FOR MOLECULAR BIOLOGY RESEARCH Open Access A new fast algorithm for detecting protein coevolution using maximum compatible cliques Alex Rodionov1 Alexandr Bezginov2 Jonathan Rose1 and Elisabeth RM Tillier2 3 Abstract Background The MatrixMatchMaker algorithm was recently introduced to detect the similarity between phylogenetic trees and thus the coevolution between proteins. MMM finds the largest common submatrices between pairs of phylogenetic distance matrices and has numerous advantages over existing methods of coevolution detection. However these advantages came at the cost of a very long execution time. Results In this paper we show that the problem of finding the maximum submatrix reduces to a multiple maximum clique subproblem on a graph of protein pairs. This allowed us to develop a new algorithm and program implementation MMMvIl which achieved more than 600x speedup with comparable accuracy to the original MMM. Conclusions MMMvIl will thus allow for more more extensive and intricate analyses of coevolution. Availability An implementation of the MMMvIl algorithm is available at http labs tillier MMMWEBvII Background An important problem in evolutionary biology is the comparison of phylogenetic trees 1 . Tree comparisons have been performed to establish the accuracy of phylogeny building methods 2-4 to determine inconsistencies between the phylogenetic history of different genes and thus determine horizontal transfer of genes between species 5 6 to find orthologous genes 4 and to identify genes that coevolve 7 8 . Some classical methods only compare tree topologies and the problem has been to identify an appropriate distance measure which describes the branch rearrangements to transform one tree into another. However most applications which aim to find correlated rates of evolution require the comparison measure to also
Tân Long
71
9
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo sinh học: " Research Article Levitin-Polyak Well-Posedness in Vector Quasivariational Inequality Problems with Functional Constraints"
16
95
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Stabilities of Cubic Mappings in Fuzzy Normed Spaces"
15
105
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Inequalities among Eigenvalues of Second-Order Symmetric Equations on Time Scales"
24
94
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Explicit Conditions for Stability of Nonlinear Scalar Delay Impulsive Difference Equation Bo Zheng"
17
100
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Existence and Uniqueness of Mild Solution for Fractional Integrodifferential Equations"
10
92
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Solutions of Linear Impulsive Differential Systems Bounded on the Entire Real Axis"
10
88
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Asymptotical Behaviors of Nonautonomous Discrete Kolmogorov System with Time Lags"
19
97
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Boundary Value Problems for Delay Differential Systems"
20
91
0
Báo cáo sinh học: "Research Article Monotone Iterative Technique for First-Order Nonlinear Periodic Boundary Value Problems on Time Scales"
10
99
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Symmetric Three-Term Recurrence Equations and Their Symplectic Structure"
17
103
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461846
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22513
57
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10863
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10028
445
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9489
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8242
1124
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8200
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7859
2219
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6643
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5754
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học hay
cách trình bày báo cáo
báo cáo sinh học
công trình nghiên cứu sinh học
tài liệu về sinh học
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
extremetech Hacking Firefox phần 7
46
185
0
19-04-2024
TƯƠNG QUAN GIỮA MÔ HỌC, GIẢI PHẪU VÀ HÌNH ẢNH CỦA CÁC KHỐI U PHẦN PHỤ
3
167
0
19-04-2024
Management and Services Part 1
10
155
0
19-04-2024
MySQL Database Usage & Administration PHẦN 9
37
137
0
19-04-2024
Đề tài: Tìm hiểu một số yêu cầu đặt ra với một phòng thu âm, để đảm bảo chất lượng âm thanh trong sản phẩm đa phương tiện
8
158
1
19-04-2024
Khurana et al. Journal of Orthopaedic Surgery and Research 2010, 5:23
7
133
0
19-04-2024
Data Structures and Algorithms - Chapter 9: Hashing
54
111
0
19-04-2024
Data Structures and Algorithms - Chapter 8: Heaps
41
115
0
19-04-2024
Khơi nguồn cảm hứng học tập, tại sao không?
4
120
1
19-04-2024
Fecal Incontinence Diagnosis and Treatment - part 8
35
100
0
19-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7859
2219
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5598
1326
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3751
1229
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8242
1124
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5247
1124
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3472
641
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10863
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3669
524
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4023
513
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4099
478
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.