Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học: "Predicting direct protein interactions from affinity purification mass spectrometry data"
tailieunhanh - Báo cáo sinh học: "Predicting direct protein interactions from affinity purification mass spectrometry data"
Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về sinh học được đăng trên tạp chí y học Molecular Biology cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành sinh học đề tài: Predicting direct protein interactions from affinity purification mass spectrometry data. | Kim et al. Algorithms for Molecular Biology 2010 5 34 http content 5 1 34 AMR ALGORITHMS FOR MOLECULAR BIOLOGY RESEARCH Open Access Predicting direct protein interactions from affinity purification mass spectrometry data Ethan DH Kim 1 Ashish Sabharwal2 Adrian R Vetta3 Mathieu Blanchette1 Abstract Background Affinity purification followed by mass spectrometry identification AP-MS is an increasingly popular approach to observe protein-protein interactions PPI in vivo. One drawback of AP-MS however is that it is prone to detecting indirect interactions mixed with direct physical interactions. Therefore the ability to distinguish direct interactions from indirect ones is of much interest. Results We first propose a simple probabilistic model for the interactions captured by AP-MS experiments under which the problem of separating direct interactions from indirect ones is formulated. Then given idealized quantitative AP-MS data we study the problem of identifying the most likely set of direct interactions that produced the observed data. We address this challenging graph theoretical problem by first characterizing signatures that can identify weakly connected nodes as well as dense regions of the network. The rest of the direct PPI network is then inferred using a genetic algorithm. Our algorithm shows good performance on both simulated and biological networks with very high sensitivity and specificity. Then the algorithm is used to predict direct interactions from a set of AP-MS PPI data from yeast and its performance is measured against a high-quality interaction dataset. Conclusions As the sensitivity of AP-MS pipeline improves the fraction of indirect interactions detected will also increase thereby making the ability to distinguish them even more desirable. Despite the simplicity of our model for indirect interactions our method provides a good performance on the test networks. Background Understanding the organization of protein-protein interactions
Công Giang
74
17
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Bấm vào đây để xem trước nội dung
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo sinh học: " Research Article Levitin-Polyak Well-Posedness in Vector Quasivariational Inequality Problems with Functional Constraints"
16
95
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Stabilities of Cubic Mappings in Fuzzy Normed Spaces"
15
105
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Inequalities among Eigenvalues of Second-Order Symmetric Equations on Time Scales"
24
94
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Explicit Conditions for Stability of Nonlinear Scalar Delay Impulsive Difference Equation Bo Zheng"
17
100
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Existence and Uniqueness of Mild Solution for Fractional Integrodifferential Equations"
10
92
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Solutions of Linear Impulsive Differential Systems Bounded on the Entire Real Axis"
10
88
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Asymptotical Behaviors of Nonautonomous Discrete Kolmogorov System with Time Lags"
19
97
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Boundary Value Problems for Delay Differential Systems"
20
91
0
Báo cáo sinh học: "Research Article Monotone Iterative Technique for First-Order Nonlinear Periodic Boundary Value Problems on Time Scales"
10
99
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Symmetric Three-Term Recurrence Equations and Their Symplectic Structure"
17
103
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461847
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
22518
57
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10865
529
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10029
445
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9490
104
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8243
1124
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8206
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7860
2220
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6646
253
Vật lý hạt cơ bản (1)
29
5755
85
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học hay
cách trình bày báo cáo
báo cáo sinh học
công trình nghiên cứu sinh học
tài liệu về sinh học
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Mass Transfer in Multiphase Systems and its Applications Part 19
40
254
1
20-04-2024
Giáo trình CẤU TRÚC DỮ LIỆU VÀ GIẢI THUẬT - Chương 1
5
123
0
20-04-2024
báo cáo hóa học:" Endoscopic decompression for intraforaminal and extraforaminal nerve root compression"
7
106
0
20-04-2024
New Trends and Developments in Automotive Industry Part 7
35
91
0
20-04-2024
Báo cáo nghiên cứu nông nghiệp " Field control of pest fruit flies in Vietnam "
14
115
0
20-04-2024
Expert CAD Management The Complete Guide phần 8
30
105
0
20-04-2024
Bảng màu theo chữ cái – V
11
98
0
20-04-2024
Hướng dẫn chế độ dinh dưỡng cho người bệnh viêm khớp
5
118
0
20-04-2024
Phương pháp trăc nghiệm 7
6
90
0
20-04-2024
Cấu trúc máy tính và lập trình Assembly : LẬP TRÌNH XỬ LÝ MÀN HÌNH & BÀN PHÍM part 5
6
104
0
20-04-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7860
2220
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
5601
1327
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3752
1229
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8243
1124
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5255
1124
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3473
641
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
10865
529
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3670
524
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4024
513
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4100
478
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.