Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
Thông tin
Điều khoản sử dụng
Quy định bảo mật
Quy chế hoạt động
Chính sách bản quyền
Giới thiệu
Đăng ký
Đăng nhập
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học: "SMOTIF: efficient structured pattern and profile motif search"
tailieunhanh - Báo cáo sinh học: "SMOTIF: efficient structured pattern and profile motif search"
Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về sinh học được đăng trên tạp chí y học Molecular Biology cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành sinh học đề tài: SMOTIF: efficient structured pattern and profile motif search. | Algorithms for Molecular Biology BioMed Central Research Open Access SMOTIF efficient structured pattern and profile motif search Yongqiang Zhang and Mohammed J Zaki Address Department of Computer Science Rensselaer Polytechnic Institute Troy New York 12180 USA Email Yongqiang Zhang - zhangy0@ Mohammed J Zaki - zaki@ Corresponding author Published 21 November 2006 Received 21 May 2006 Algorithms for Molecular Biology 2006 1 22 doi 1748-7188-1 -22 Accepted 21 November 2006 This article is available from http content 1 1 22 2006 Zhang and Zaki licensee BioMed Central Ltd. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License http licenses by which permits unrestricted use distribution and reproduction in any medium provided the original work is properly cited. Abstract Background A structured motif allows variable length gaps between several components where each component is a simple motif which allows either no gaps or only fixed length gaps. The motif can either be represented as a pattern or a profile also called positional weight matrix . We propose an efficient algorithm called SMOTIF to solve the structured motif search problem . given one or more sequences and a structured motif SMOTIF searches the sequences for all occurrences of the motif. Potential applications include searching for long terminal repeat LTR retrotransposons and composite regulatory binding sites in DNA sequences. Results SMOTIF can search for both pattern and profile motifs and it is efficient in terms of both time and space it outperforms SMARTFINDER a state-of-the-art algorithm for structured motif search. Experimental results show that SMOTIF is about 7 times faster and consumes 100 times less memory than SMARTFINDER. It can effectively search for LTR retrotransposons and is well suited to searching for motifs with long range gaps. It is also successful in finding .
Thụy Vân
113
24
pdf
Báo lỗi
Trùng lắp nội dung
Văn hóa đồi trụy
Phản động
Bản quyền
File lỗi
Khác
Upload
Tải xuống
đang nạp các trang xem trước
Không thể tạo bản xem trước, hãy bấm tải xuống
Tải xuống
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo sinh học: " Research Article Levitin-Polyak Well-Posedness in Vector Quasivariational Inequality Problems with Functional Constraints"
16
95
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Stabilities of Cubic Mappings in Fuzzy Normed Spaces"
15
105
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Inequalities among Eigenvalues of Second-Order Symmetric Equations on Time Scales"
24
94
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Explicit Conditions for Stability of Nonlinear Scalar Delay Impulsive Difference Equation Bo Zheng"
17
100
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Existence and Uniqueness of Mild Solution for Fractional Integrodifferential Equations"
10
92
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Solutions of Linear Impulsive Differential Systems Bounded on the Entire Real Axis"
10
88
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Asymptotical Behaviors of Nonautonomous Discrete Kolmogorov System with Time Lags"
19
97
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Boundary Value Problems for Delay Differential Systems"
20
91
0
Báo cáo sinh học: "Research Article Monotone Iterative Technique for First-Order Nonlinear Periodic Boundary Value Problems on Time Scales"
10
99
0
Báo cáo sinh học: " Research Article Symmetric Three-Term Recurrence Equations and Their Symplectic Structure"
17
103
0
TÀI LIỆU XEM NHIỀU
Một Case Về Hematology (1)
8
461996
55
Giới thiệu :Lập trình mã nguồn mở
14
23443
69
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
11060
535
Câu hỏi và đáp án bài tập tình huống Quản trị học
14
10273
453
Phân tích và làm rõ ý kiến sau: “Bài thơ Tự tình II vừa nói lên bi kịch duyên phận vừa cho thấy khát vọng sống, khát vọng hạnh phúc của Hồ Xuân Hương”
3
9599
106
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8503
1145
Tiểu luận: Nội dung tư tưởng Hồ Chí Minh về đạo đức
16
8320
423
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7906
2240
Đề tài: Dự án kinh doanh thời trang quần áo nữ
17
6917
258
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
6455
1562
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học hay
cách trình bày báo cáo
báo cáo sinh học
công trình nghiên cứu sinh học
tài liệu về sinh học
TÀI LIỆU MỚI ĐĂNG
Đánh giá hao mòn và độ tin cậy của chi tiết và kết cấu trên đầu máy diezel part 3
12
331
1
09-06-2024
Sáng tạo trong thuật toán và lập trình với ngôn ngữ Pascal và C# Tập 2 - Chương 4
47
275
1
09-06-2024
Management and Services Part 1
10
176
1
09-06-2024
Posted prices versus bargaining in markets_7
23
171
0
09-06-2024
Công nghiệp gang thép Việt Nam : Một giai đoạn phát triển và chuyển đổi chính sách mới part 5
6
209
0
09-06-2024
THE ANTHROPOLOGY OF ONLINE COMMUNITIES BY Samuel M.Wilson and Leighton C. Peterson
19
174
2
09-06-2024
Đóng mới oto 8 chỗ ngồi part 9
10
139
1
09-06-2024
Giáo trình CẤU TRÚC DỮ LIỆU VÀ GIẢI THUẬT - Chương 1
5
146
0
09-06-2024
Data Structures and Algorithms - Chapter 8: Heaps
41
137
1
09-06-2024
báo cáo hóa học:" Journal of the International AIDS Society: an important step forward"
2
98
0
09-06-2024
TÀI LIỆU HOT
Mẫu đơn thông tin ứng viên ngân hàng VIB
8
7906
2240
Giáo trình Tư tưởng Hồ Chí Minh - Mạch Quang Thắng (Dành cho bậc ĐH - Không chuyên ngành Lý luận chính trị)
152
6455
1562
Ebook Chào con ba mẹ đã sẵn sàng
112
3945
1289
Ebook Tuyển tập đề bài và bài văn nghị luận xã hội: Phần 1
62
5556
1155
Ebook Facts and Figures – Basic reading practice: Phần 1 – Đặng Tuấn Anh (Dịch)
249
8503
1145
Giáo trình Văn hóa kinh doanh - PGS.TS. Dương Thị Liễu
561
3591
662
Giáo trình Sinh lí học trẻ em: Phần 1 - TS Lê Thanh Vân
122
3796
571
Tiểu luận: Tư tưởng Hồ Chí Minh về xây dựng nhà nước trong sạch vững mạnh
13
11060
535
Giáo trình Pháp luật đại cương: Phần 1 - NXB ĐH Sư Phạm
274
4234
527
Bài tập nhóm quản lý dự án: Dự án xây dựng quán cafe
35
4261
483
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.