tailieunhanh - Luận văn : THU THẬP VÀ TỔ CHỨC DỮ LIỆU GENE PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU CÂY TRỒNG BIẾN ĐỔI DI TRUYỀN part 6

Hình : Kết quả cuối cùng sau khi chƣơng trình phân Division đã chạy xong Dữ liệu của ta đƣợc phân loại theo từng trƣờng riêng biệt, đây là cấu tạo tầng dữ liệu của ta. Thống kê kết quả cuối cùng, tất cả các trình tự đƣợc phân loại vào các trƣờng nhƣ sau: PLN: 3129 trình tự. BCT: 476 trình tự. VRL: 662 trình tự. PAT: 228 trình tự. SYN: 210 trình tự. EST: 874 trình tự. INV: 36 trình tự. STS: 1 trình tự. GSS: 10 trình tự. ENV: . | PHẦN D KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 97 Hình Kết quả cuối cùng sau khi chương trình phân Division đã chạy xong Dữ liệu của ta được phân loại theo từng trường riêng biệt đây là cấu tạo tầng dữ liệu của ta. Thống kê kết quả cuối cùng tất cả các trình tự được phân loại vào các trường như sau PLN 3129 trình tự. BCT 476 trình tự. VRL 662 trình tự. PAT 228 trình tự. SYN 210 trình tự. EST 874 trình tự. INV 36 trình tự. STS 1 trình tự. GSS 10 trình tự. ENV 1 trình tự. VRT 1 trình tự. Qua khảo sát tài liệu và các record Genbank có nhận xét sau Các gene dùng trong thực vật biến đổi di truyền hiện nay đa số từ thực vật vi khuẩn virus ngoài ra còn một số trình tự được tổng hợp nhân tạo như CrylAb cp4epsps. Các trình tự này chủ yếu nằm trên các khu vực PLN BCT VRL PAT SYN EST các trường còn lại chứa các trình tự dư thừa vì thế ta chỉ cho tìm kiếm trên các khu vực chứa trình tự quan tâm. NGUYỄN KỲ TRUNG - LÊ THÀNH TRUNG PHẦN D KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 98 V. Java tiến hành xử lý dữ liệu Xây dựng ứng dụng tra cứu dữ liệu trình tự thông qua các keyword do nguời dùng chọn lựa và nhập vào. . Các yêu cầu đặt ra Với keyword bất kỳ nhập vào cần tìm đuợc file chứa từ đó trong nội dung. Để thông tin tìm đuợc đúng mong muốn ta sẽ tạo thêm các giới hạn tìm kiếm. Có hai mức giới hạn đuợc đặt ra Mức dữ liệu ta cho nguời dùng giới hạn tìm kiếm trên các bộ dữ liệu o Thực vật Plant o Vi khuẩn bacterial o Virus viral o EST EST o SYN SYN o PAT PAT Mức các truờng trong record GenBank o LOCUSID o Length o Molecular type o DEFINITION o ACCESSION NUMBER o VERSION o GI o ORGANISM o AUTHOR o TITLE o JOURNAL o Gene name o Product name Nguời dùng có thể kết hợp các yêu cầu qua các toán tử AND OR NOT để tìm kiếm chính xác thông tin cần tìm. NGUYỄN KỲ TRUNG - LÊ THÀNH TRUNG PHẦN D KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 99 . Xử lý yêu cầu bằng Java và Biojava Phân tích nội dung của dữ liệu genbank. Có thể phân nội dung thành hai phần Phần tìm kiếm thông tin liên quan đến trình tự Bắt đầu từ trường LOCUS đến phần bắt đầu của .