tailieunhanh - GIẢI TRÌNH TỰ GEN

Có 2 phương pháp chính - Phương pháp hóa học Maxam – Gilbert: đây là phương pháp được sử dụng đầu tiên để xác định trình tự gen nhưng hiện nay không còn được sử dụng phổ biến nữa - Phương pháp Enzyme Sanger Nguyên lý - Sử dụng các chất hóa học cắt đứt sợi DNA lại 1 loại nucleotide đặc hiệu | GIẢI TRÌNH TỰ GEN C¸c ph­¬ng ph¸p gi¶i tr×nh tù gen Cã 2 ph­¬ng ph¸p chÝnh: Ph­¬ng ph¸p ho¸ häc Maxam – Gilbert: ®©y lµ ph­¬ng ph¸p ®­îc sö dông ®Çu tiªn ®Ó x¸c ®Þnh tr×nh tù gen nh­ng hiÖn nay kh«ng cßn ®ù¬c sö dông phæ biÕn n÷a. Ph­¬ng ph¸p Enzyme Sanger 1. Ph­¬ng ph¸p ho¸ häc Maxam - Gilbert Walter Gilbert Nguyªn lý Sö dông c¸c chÊt ho¸ häc c¾t ®øt sîi DNA t¹i 1 lo¹i nucleotide ®Æc hiÖu Ph©n tö DNA kÐp ®­îc ®¸nh dÊu P32 t¹i ®Çu 5’ T¸ch rêi 2 sîi ®¬n b»ng nhiÖt Xö lý ho¸ häc sao cho chØ cã 1 lo¹i nucleotide bÞ ph¸ huû -> hµng lo¹t ®o¹n DNA cã kÝch th­íc kh¸c nhau ®­îc t¹o thµnh (sö dông c¸c chÊt ho¸ häc kh¸c nhau ph¸ huû 4 lo¹i nucleotide b»ng 4 ph¶n øng riªng biÖt) TiÕn hµnh ®iÖn di c¸c ®o¹n DNA thu ®ù¬c trªn gel polyacrylamide, chØ quan s¸t ®ù¬c ®o¹n cã g¾n P32. §o¹n DNA ng¾n nhÊt cã ®¸nh dÊu phãng x¹ sÏ ch¹y nhanh nhÊt d­íi t¸c dông cña ®iÖn tr­êng. C¨n cø vµo vÞ trÝ c¸c v¹ch quan s¸t ®­îc trªn gel mµ x¸c ®Þnh tr×nh tù c¸c nucleotide. 5’- Treat with chemicals that specifically cleave at a certain base. 4 tubes G-rxn A>G -rxn T>C -rxn C-rxn 5’- 5’- 5’- C The reaction is done such that each strand is cleaved only once C T A G ddNTP Reaction Mix 3’ G C A T T C C A T A G G 5’ MAXAM-GILBERT CHEMICAL SEQUENCING Labeled strand (P32) C C Sequence is read directly autoradiograph of dried sequencing gel Ph¸ huû c¸c nucleotide Trong ph­¬ng ph¸p nµy sö dông 5 ph¶n øng c¬ b¶n: Dimethylsulfate ë pH sÏ lµm thay ®æi Guanine (G). Piperidine formate ë pH sÏ ph¸ vì cÇu nèi glycoside gi÷a deoxyribose víi purine (G,A) Hydrazine: më c¸c vßng pyrimidine (C , T) Hydrazine khi cã NaCl chØ cã t¸c dông ®èi víi C NaOH ë 900C sÏ ph¸ huû A m¹nh vµ C kÐm. KÕt qu¶: Dimethylsulfate at pH -----------> G Piperidine formate at pH -------> G and A Hydrazine ------------------------------> C and T Hydrazine in M NaCl -----------> C N NaOH at 90 oC -----------------> A and C 5’GACGTACTTA3’ G G+A T+C C A>C N NaOH at 90 oC A>C Hydrazine T+C Piperidine formate | GIẢI TRÌNH TỰ GEN C¸c ph­¬ng ph¸p gi¶i tr×nh tù gen Cã 2 ph­¬ng ph¸p chÝnh: Ph­¬ng ph¸p ho¸ häc Maxam – Gilbert: ®©y lµ ph­¬ng ph¸p ®­îc sö dông ®Çu tiªn ®Ó x¸c ®Þnh tr×nh tù gen nh­ng hiÖn nay kh«ng cßn ®ù¬c sö dông phæ biÕn n÷a. Ph­¬ng ph¸p Enzyme Sanger 1. Ph­¬ng ph¸p ho¸ häc Maxam - Gilbert Walter Gilbert Nguyªn lý Sö dông c¸c chÊt ho¸ häc c¾t ®øt sîi DNA t¹i 1 lo¹i nucleotide ®Æc hiÖu Ph©n tö DNA kÐp ®­îc ®¸nh dÊu P32 t¹i ®Çu 5’ T¸ch rêi 2 sîi ®¬n b»ng nhiÖt Xö lý ho¸ häc sao cho chØ cã 1 lo¹i nucleotide bÞ ph¸ huû -> hµng lo¹t ®o¹n DNA cã kÝch th­íc kh¸c nhau ®­îc t¹o thµnh (sö dông c¸c chÊt ho¸ häc kh¸c nhau ph¸ huû 4 lo¹i nucleotide b»ng 4 ph¶n øng riªng biÖt) TiÕn hµnh ®iÖn di c¸c ®o¹n DNA thu ®ù¬c trªn gel polyacrylamide, chØ quan s¸t ®ù¬c ®o¹n cã g¾n P32. §o¹n DNA ng¾n nhÊt cã ®¸nh dÊu phãng x¹ sÏ ch¹y nhanh nhÊt d­íi t¸c dông cña ®iÖn tr­êng. C¨n cø vµo vÞ trÝ c¸c v¹ch quan s¸t ®­îc trªn gel mµ x¸c ®Þnh tr×nh tù c¸c nucleotide. 5’- Treat with chemicals that specifically .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN
19    156    3
TỪ KHÓA LIÊN QUAN
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.