tailieunhanh - Báo cáo nông nghiệp: "NGHIÊN CứU BIếN ĐổI THàNH PHầN GEN H5 CủA VIRUS CúM A/H5N1 PHÂN LậP Từ Gà HậU GIANG SO SáNH VớI CáC CHủNG CủA VIệT NAM Và VùNG ĐÔNG NAM CHÂU á (2005 - 2008)"

Toàn bộ gen HA (H5) (gồm 1707 bp) của một chủng virus cúm A/H5N1 phân lập từ gà tại Hậu Giang năm 2005 (ký hiệu A/Ck/Vietnam/HG4/2005) đã được thu nhận, giải trình trình tự (đăng ký Ngân hàng gen số: EF051513). | Tạp chí Khoa học và Phát triển 2008 Tập VI Số 6 562-569 ĐẠI HỌC NÔNG NGHIỆP HÀ NỘI NGHIÊN CỨU BIẾN ĐÔÌ THÀNH PHAN GEN H5 CỦA VIRUS CÚM A H5N1 PHÂN LẬP Từ GÀ HẬU GIANG SO SÁNH VỚI CÁC CHỦNG CỦA VIỆT NAM VÀ VUNG ĐÔNG NAM CHÂU Á 2005 - 2008 Genetic Analysis of HA H5 of Influenza Virus A H5N1 Isolated from Chicken in Hau Giang in Comparison with the Strains Isolated in Vietnam and Southeast Asian Region 2005 - 2008 Trần Quang Vui1 Nguyễn Thị Bích Nga2 và Lê Thanh Hoà2 Trường Đại học Nông Lâm Đại học Huế 2Viện Công nghệ Sinh học Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam TÓM TẮT Toàn bộ gen HA H5 gồm 1707 bp của một chủng virus cúm A H5N1 phân lập từ gà tại Hậu Giang năm 2005 ký hiệu A Ck Vietnam HG4 2005 đã được thu nhận giải trình trình tự đăng ký Ngân hàng gen số EF051513 . Thành phần nucleotide amino acid gen H5 của A Ck Vietnam HG4 2005 H5N1 được sử dụng để phân tích và xây dựng quan hệ phả hệ giữa chủng này với một số chủng của Trung Quốc Việt Nam và Đông Nam Á phân lập trong các năm 2005 - 2008. Kết quả phân tích và so sánh cho thấy thành phần nucleotide gen H5 của chủng A Ck Vietnam HG4 2005 Hậu Giang có 9 vị trí sai khác hoàn toàn so với 19 chủng so sánh phân lập từ các vùng miền khác nhau của Việt Nam và châu Á. Tỷ lệ đồng nhất identity của gen H5 về nucleotide thấp nhất là 98 và tỷ lệ tương đồng homology về amino acid thấp nhất là 97 giữa chủng A Ck Vietnam HG4 2005 so với các chủng virus cúm A H5N1 từ miền Nam Việt Nam Long An Hậu Giang Kiên Giang Cà Mau và Bến Tre Trung Quốc và Đông Nam Á phân lập trong các năm 2005 - 2008. Chủng A Ck Vietnam HG4 2005 được khẳng định cùng nguồn gốc dưới dòng Quảng Đông nhưng có thành phần gen khác nhiều so với các chủng dưới dòng Phúc Kiến. Hỗn hợp virus cúm A H5N1 gây bệnh tại Việt Nam có thể là vấn đề nên quan tâm để có phương hướng về chẩn đoán dịch tễ và phòng chống. Từ khoá Cúm A H5N1 dưới dòng HA H5 phả hệ thành phần nucleotide amino acid. SUMMARY The entire HA H5 gene 1707 bp of an avian influenza isolate collected from .