tailieunhanh - Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự chuỗi để xác định kiểu gen virus viêm gan B

Những tiến bộ của kỹ thuật sinh học phân tử vào những năm cuối thế kỹ 20 đã giúp khám phá ra sự đa dạng trong trình tự chuỗi của vi rút viêm gan B, và từ đó một dấu ấn (marker) mới của HBV ra đời là HBV genotype. Tám kiểu gen của HBV đã được xác định (Từ A đến H) dựa vào sự khác nhau trên 8% của toàn bộ trình tự chuỗi của bộ gen HBV, và sự phân bố của các kiểu gen khác nhau ở các châu lục, các nước khác nhau. . | Ứng dụng kỹ thuật giải trình tự chuỗi để xác định kiểu gen virus viêm gan B Những tiến bộ của kỹ thuật sinh học phân tử vào những năm cuối thế kỹ 20 đã giúp khám phá ra sự đa dạng trong trình tự chuỗi của vi rút viêm gan B và từ đó một dấu ấn marker mới của HBV ra đời là HBV genotype. Tám kiểu gen của HBV đã được xác định Từ A đến H dựa vào sự khác nhau trên 8 của toàn bộ trình tự chuỗi của bộ gen HBV và sự phân bố của các kiểu gen khác nhau ở các châu lục các nước khác nhau. Tuy nhiên sự phân loại các HBV genotypes có thể chỉ cần dựa trên trình tự chuỗi sequence của một đoạn gen nào đó của HBV như trên một phần trình tự chuỗi của gen pre-S S. Có nhiều phương pháp đã được nghiên cứu và dùng trong việc xác định HBV genotypes như giải trình tự chuỗi sequencing RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism LiPA Line Probe Assay phản ứng miễn dịch men Enzyme-linked Immunoassay . Mỗi phương pháp có những ưu và nhược điểm khác nhau tuy nhiên phương pháp giải trình tự chuỗi có thể xem như có nhiều ưu điểm nổi bật vì bên cạnh việc xác định được trình tự chuỗi các Nucleotids trong bộ gen của HBV để từ đó so sánh với thư viện gen và xác định được HBV genotypes mà còn dựa vào kết quả giải trình tự này chúng ta có thể xác định được một số dạng đột biến kháng thuốc của HBV để từ đó có phát đồ điều trị tối ưu 1. Khái niệm về cấu trúc phân tử DNA DNA là một chuỗi xoắn kép hai mạch đơn được nối với nhau bằng liên kết Hydro. Mối liên kết này có thể bị phá vỡ bởi nhiệt độ cao Thường là trên 90oC và ứng dụng thực tế là 940C làm cho phân tử DNA biến thành 2 mạch đơn. Có 4 loại Nucleotid Nu căn bản cấu tạo nên DNA A Adenine T Thymine G Guanine C Cytosine . Việc xác định được thứ tự các Nu gắn kết với nhau dọc theo chiều dài của bộ gen DNA gọi là việc giải trình tự chuỗi Sequencing và trình tự gắn kết nhau của các Nu gọi là trình tự chuỗi Sequence . 2. Cấu tạo bộ gen HBV HBV có bộ gen là phân tử DNA chiều dài khoảng 3200 bases. Hoạt động nhân đôi của HBV nhờ hoạt tính của men .