tailieunhanh - Báo cáo nghiên cứu khoa học: "ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP PCR-GENOTYPI NG (ORF94) TRONG NGHIÊN CỨU VI RÚT GÂY BỆNH ĐỐM TRẮNG TRÊN TÔM SÚ (Penaeus monodon)"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu khoa học của trường đại học cần thơ trên tạp chí nghiên cứu khoa học đề tài: ỨNG DỤNG PHƯƠNG PHÁP PCR-GENOTYPI NG (ORF94) TRONG NGHIÊN CỨU VI RÚT GÂY BỆNH ĐỐM TRẮNG TRÊN TÔM SÚ (Penaeus monodon). | Tạp chí Nghiên cứu Khoa học 2008 1 163-169 Trường Đại học Cần Thơ ỨNG D ỤNG PHƯƠ NG PHÁP PCR-GENO TYPI NG ORF94 TRONG NGHIÊN CỨU VI RÚT GÂY BỆNH ĐỐM TRẮNG TRÊN TÔM SÚ Penaeus monodon Trần Thị Tuyết Hoa1 Triệu Thanh Tuấn và Nguyễn Thanh Phương1 ABSTRACT White spot disease causative agent is white spot syndrome virus WSSV is one of the serious diseases responsible for most economic losses in the shrimp farming industry in the Mekong Delta and worldwide. This study aims to identify molecular markers that discriminate different WSSV genotypes causing the disease in black tiger shrimps. PCR-genotyping amplified tandem repeat region of 54bp in ORF94 GenBank AF369029 was used to analyze 169 WSSV-infected shrimps collected from 19 diseased shrimp ponds in Bac Lieu and Ca Mau provinces. The result shows that i there are 7 different tandem-repeat-sequence TRS groups 4- 5- 6- 7- 9- 12- and 16-TRS with the WSSV genotype of 5-TRS being the most prevalence. In Bac Lieu province there are 6 WSSV genotypes 4-TRS 5-TRS 7-TRS 9-TRS 12-TRS 16-TRS at percentages 11 1 48 8 1 1 22 2 11 1 and 5 7 respectively. In Ca Mau province four WSSVgenotypes were identified at these frequencies 68 4 of 5-TRS 7 6 of 6-TRS 14 of 7-TRS and 28 6 of 9-TRS. ii The number of tandem-repeat-sequences of WSSV isolates remains constant across the diseased shrimp ponds 16 19 ponds . The results obtained so far suggest that PCR-genotyping ORF94 is a suitable method for WSSV strains identification. Keywords White spot syndrome virus molecular marker ORF94 Title Application of PCR-genotyping ORF94 to study white spot syndrome virus WSSV infection in shrimp Penaeus monodon TÓM TẮT Bệnh đốm trắng tác nhân là white spot syndrome virus WSSV là một trong những bệnh gây thiệt hại nghiêm trọng đến nghề nuôi tôm biển ở vùng ĐBSCL và trên toàn thế giới. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm tìm ra chỉ thị phân tử đánh dấu sự khác nhau về kiểu gen của WSSV gây bệnh trên tôm sú. Phương pháp PCR-genotyping khuếch đại đoạn lặp .