tailieunhanh - Xác định các tương tác của protein xuyên màng nấm men trên quy mô lớn

Miller và đồng sự thực hiện sàng lọc trên quy mô lớn để xác định tương tác giữa các protein xuyên màng của Saccharomyces cerevisiae bằng kỹ thuật ubiquitin phân tách cải tiến (modified split-ubiquitin). Trong số 705 protein xuyên màng đã chú thích, các tác giả xác định được tương tác giả định liên quan đến 536 protein. | Xác định các tương tác của protein xuyên màng nấm men trên quy mô lớn Miller và đồng sự thực hiện sàng lọc trên quy mô lớn để xác định tương tác giữa các protein xuyên màng của Saccharomyces cerevisiae bằng kỹ thuật ubiquitin phân tách cải tiến modified split-ubiquitin . Trong số 705 protein xuyên màng đã chú thích các tác giả xác định được tương tác giả định liên quan đến 536 protein. Nhằm tăng độ tin cậy họ sử dụng thuật toán SVM support vector machine để phân loại các tương tác dựa trên kết quả thí nghiệm và dữ liệu protein thu được từ các nguồn tài liệu sẵn có khác. Sử dụng các tương tác đã xác định cũng như được đưa ra nhờ máy tính trước đây để huấn luyện SVM. Qua đó tìm ra 4 nhóm tương tác theo mức độ tin cậy giảm dần gồm 131 tương tác có độ tin cậy cao nhất tiếp đến là 209 468 và tương tác có độ tin cậy thấp. Nghiên cứu này đã tìm thấy có rất nhiều tương tác giả định của một nhóm protein mà thật sự chúng khó phân tích v ới hiệu suất cao nếu dùng các cách tiếp cận .