tailieunhanh - Ứng dụng giải trình tự gene thế hệ mới (NGS) để sàng lọc đa hình nucleotide đơn (SNP) liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở tu hài (Lutraria rhynchaen, Jonas 1844)

Bài viết Ứng dụng giải trình tự gene thế hệ mới (NGS) để sàng lọc đa hình nucleotide đơn (SNP) liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở tu hài (Lutraria rhynchaen, Jonas 1844) tiến hành giải trình tự gen thế hệ mới và sàng lọc chỉ thị SNP cho hai nhóm tu hài và marker SNP sàng lọc được sẽ cung cấp nguồn cơ sở dữ liệu quan trọng phục vụ cho công tác chọn giống ở tu hài liên quan đến tính trạng tăng trưởng trong thời gian tới. | TNU Journal of Science and Technology 228 05 89 - 96 APPLICATION OF NEXT GENERATION SEQUENCING NGS FOR SCREENING SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS SNP RELATED TO GROWTH TRAITS OF OTTER CLAM Lutraria rhynchaen Jonas 1844 Trieu Anh Tuan1 Thai Thanh Binh2 1Hung Vuong University 2Fisheries and Technical Economic College ARTICLE INFO ABSTRACT Received 06 12 2022 Otter clam farming in Van Don Quang Ninh has been encountering difficulties because of poor quality of breeds and more frequent Revised 05 4 2023 disease outbreaks. On that basis it is necessary to conduct genetic Published 13 4 2023 studies to improve the source of breeds especially the combination of quantitative inheritance and molecular genetics to select desirable KEYWORDS traits by molecular indicator. In this study we employed next- generation sequencing of gene technology NovaSeq6000 to sequence Otter clam and screen single nucleotide polymorphism SNPs that relates to Growth growth traits in otter clam. The results was screened shows that total Sequencing 1 470 534 SNPs to 2 groups in which SNPs only appeared in fast-growing group SNPs only appeared in slow-growing Screening group and SNPs appeared in both groups. Through screening SNP and genetic linkage analysis 20 potential SNPs for fast-growing group and 12 potential SNPs for slow-growing group were achieved. The study suggests that SNP Screen should be employed as a molecular indicator method to serve geoduck breed selection in Vietnam. ỨNG DỤNG GIẢI TRÌNH TỰ GENE THẾ HỆ MỚI NGS ĐỂ SÀNG LỌC ĐA HÌNH NUCLEOTIDE ĐƠN SNP LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH TRẠNG TĂNG TRƯỞNG Ở TU HÀI Lutraria rhynchaen Jonas 1844 Triệu Anh Tuấn1 Thái Thanh Bình2 1Trường Đại học Hùng Vương 2Trường Cao đẳng kinh tế Kỹ thuật và Thủy sản THÔNG TIN BÀI BÁO TÓM TẮT Ngày nhận bài 06 12 2022 Nghề nuôi tu hài Lutraria rhynchaena tại huyện Vân Đồn tỉnh Quảng Ninh hiện nay gặp nhiều khó khăn do chất lượng con giống Ngày hoàn thiện 05 4 2023 thấp dịch bệnh thường xuyên xảy ra.