tailieunhanh - Đánh giá đa dạng di truyền và cấu trúc quần thể một số đàn cá chép ở Việt Nam

Nghiên cứu này đánh giá đa dạng di truyền, cấu trúc quần thể, phát sinh loài của 7 đàn cá chép bao gồm: cá chép trắng Việt Nam (VN), cá chép chọn giống V1 (V1), cá chép vảy Hungary (HV), cá chép vàng Indonesia (IN), cá chép vảy Hungary đàn Tata (TAT), cá chép vảy Hungary đàn Szarvas (SZA) và cá chép Cộng hòa Séc (SE) dựa trên phân tích trình tự gen COI và D-loop. | KHOA HỌC CÔNG NGHỆ ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÀ CẤU TRÚC QUẦN THỂ MỘT SỐ ĐÀN CÁ CHÉP Ở VIỆT NAM Vũ Thị Trang1 Lưu Thị Hà Giang1 Phạm Hồng Nhật1 Lê Văn Khôi1 Bùi Thị Ánh Nguyệt2 Nguyễn Hữu Đức2 Đặng Thị Lụa1 2 TÓM TẮT Nghiên cứu này đánh giá đa dạng di truyền cấu trúc quần thể phát sinh loài của 7 đàn cá chép bao gồm cá chép trắng Việt Nam VN cá chép chọn giống V1 V1 cá chép vảy Hungary HV cá chép vàng Indonesia IN cá chép vảy Hungary đàn Tata TAT cá chép vảy Hungary đàn Szarvas SZA và cá chép Cộng hòa Séc SE dựa trên phân tích trình tự gen COI và D-loop. Kết quả chỉ ra rằng đàn VN và V1 là đàn có đa dạng di truyền cao nhất trong khi các đàn HV TAT SZA SE và IN có đa dạng di truyền thấp khi xét trên cả 2 gen COI và D-loop. Nghiên cứu đã xác định được 53 haplotype trình tự các haplotype đã được công bố trên GenBank - NCBI với mã số MW450991 - MW451003 gen COI và MW463062 - MW463101 gen D-loop . Về sai khác di truyền đáng chú ý nhất là sự sai khác di truyền xét trên gen COI giữa đàn SE với tất cả các đàn cá chép còn lại đặc biệt là giữa SE và HV giữa SE và SZA đều có FST 1 cho thấy không có sự chia sẻ về mặt di truyền giữa các đàn này. Kết quả phân tích AMOVA dựa trên gen COI cho thấy các đàn có cấu trúc quần thể rõ ràng do sự đóng góp đáng kể về khác biệt di truyền giữa các đàn. Cây phát sinh loài phân tử cho thấy mối quan hệ di truyền xa giữa SE và các đàn còn lại xét trên gen COI và mối quan hệ di truyền gần gũi của 7 đàn xét trên gen D-loop . Nghiên cứu đã góp phần tạo cơ sở dữ liệu nguồn gen tham chiếu và phụ trợ cho các nghiên cứu cần thông tin về nguồn gen của một số đàn cá chép ở Việt Nam hiện nay đồng thời phục vụ công tác chọn giống và bảo tồn nguồn gen. Từ khóa COI D-loop cá chép đa dạng di truyền haplotype. 1. ĐẶT VẤN ĐỀ4 Hungary đàn Tata và cá chép vẩy Hungary đàn Szarvas. Ngoài các đàn cá trên thực tế trong các Cá chép Cyprinus carpio thuộc bộ doanh nghiệp và trang trại tư nhân còn lưu giữ nguồn Cypriniformes và họ Cyprinidae được coi là họ cá gen của