tailieunhanh - Xác định vị trí phân loại của họ limnocharitaceae bằng dữ liệu phân tử dựa trên dna tổng từ quy trình tách chiết nhanh

Nghiên cứu này giới thiệu một quy trình tách chiết DNA nhanh và hiệu quả từ phương pháp CTAB cải tiến, từ đó, áp dụng vào phản ứng PCR khuếch đại vùng trình tự matK của loài Limnocharis flava nhằm xác định vị trí phân loại của họ Limnocharitaceae. Kết quả cho thấy, trình tự của sản phẩm PCR được khuếch đại từ DNA tổng được tách chiết bằng phương pháp CTAB cải tiến cho kết quả có độ tin cậy cao. | Chuyên san Phát triển Khoa học và Công nghệ số 4 1 2018 XÁC ĐỊNH VỊ TRÍ PHÂN LOẠI CỦA HỌ LIMNOCHARITACEAE BẰNG DỮ LIỆU PHÂN TỬ DỰA TRÊN DNA TỔNG TỪ QUY TRÌNH TÁCH CHIẾT NHANH Huỳnh Nữ Băng Thùy Nguyễn Anh Đức Trình Trung Hiếu Võ Tuấn Dũng Văn Hồng Thiện Viện Công nghệ Sinh học và Thực phẩm Trường Đại học Công nghiệp Tác giả liên lạc vanhongthien@ Ngày nhận bài 22 12 2017 Ngày duyệt đăng 22 3 2018 TÓM TẮT Nghiên cứu này giới thiệu một quy trình tách chiết DNA nhanh và hiệu quả từ phương pháp CTAB cải tiến từ đó áp dụng vào phản ứng PCR khuếch đại vùng trình tự matK của loài Limnocharis flava nhằm xác định vị trí phân loại của họ Limnocharitaceae. Kết quả cho thấy trình tự của sản phẩm PCR được khuếch đại từ DNA tổng được tách chiết bằng phương pháp CTAB cải tiến cho kết quả có độ tin cậy cao. Ngoài ra phân tích phả hệ cũng cho thấy các loài thuộc họ Limnocharitaceae đều xếp gọn bên trong các loài thuộc họ Alismataceae từ đó đã khẳng định lại vị trí phân loại của họ Limnocharitaceae. Từ khóa Tách chiết DNA limnocharis flava limnocharitaceae alismataceae. TAXONOMIC IDENTITY OF LIMNOCHARITACEAE BASED ON MOLECULAR DATA FROM A RAPID DNA EXTRACTION PROTOCOL Huynh Nu Bang Thuy Nguyen Anh Duc Trinh Trung Hieu Vo Tuan Dung Van Hong Thien Institute of Biotechnology and Food Technology Industrial University of Ho Chi Minh City Corresponding Author vanhongthien@ ABSTRACT In this study we used a rapid and effective DNA extraction protocol which are modified from CTAB method to amplify matK sequence of Limnocharis flava for determination of taxonomic position of Limnocharitaceae family. The data demonstrated that the matK sequence amplified by this protocol had high reliability. Furthermore phylogenetic analysis revealed that species of Limnocharitaceae nested in Alismataceae family and thus taxonomic position of Limnocharitaceae family was re-classified. Keywords DNA extraction limnocharis flava limnocharitaceae alismataceae. TỔNG QUAN .