tailieunhanh - Kết quả bước đầu phát triển bộ chỉ thị microsatellite mới từ hệ gen cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) bằng công cụ tin sinh học

Cá Tra (Pangasianodon hypophthalmus, Sauvage 1878) là một trong những đối tượng xuất khẩu chủ lực của ngành thủy sản ở Việt Nam. Các nghiên cứu trước đây đã phát triển thành công một số bộ chỉ thị microsatellite trên cá Tra và các loài khác thuộc họ Pangasiidae bằng các phương pháp truyền thống. | VIỆN NGHIÊN CỨU NUÔI TRỒNG THỦY SẢN II KẾT QUẢ BƯỚC ĐẦU PHÁT TRIỂN BỘ CHỈ THỊ MICROSATELLITE MỚI TỪ HỆ GEN CÁ TRA Pangasianodon hypophthalmus BẰNG CÔNG CỤ TIN SINH HỌC Nguyễn Văn Sáng1 Nguyễn Minh Thành2 Võ Hồng Lộc1 Nguyễn Hoàng Thông1 Lê Hoàng Khôi Nguyên2 TÓM TẮT Cá Tra Pangasianodon hypophthalmus Sauvage 1878 là một trong những đối tượng xuất khẩu chủ lực của ngành thủy sản ở Việt Nam. Các nghiên cứu trước đây đã phát triển thành công một số bộ chỉ thị microsatellite trên cá Tra và các loài khác thuộc họ Pangasiidae bằng các phương pháp truyền thống. Tuy nhiên ứng dụng của các microsatellite này chưa thỏa mãn được các yêu cầu trong công tác chọn giống cá Tra. Vì vậy nghiên cứu hiện tại đã phát triển bộ multiplex PCR gồm 10 chỉ thị microsatellite mới dựa trên hệ gen cá Tra được công bố vào năm 2018. Kết quả phân tích trên 30 mẫu cá Tra cho thấy số lượng alen NA dao động từ 5 đến 11 mỗi locus. Hệ số đa dạng di truyền PIC trung bình tỷ lệ dị hợp tử thực tế HO trung bình và tỷ lệ dị hợp tử lý thuyết HE trung bình trên tất cả các locus lần lượt là 0 729 0 755 và 0 711. Mười chỉ thị microsatellite không cho thấy sự sai khác với cân bằng Hardy-Weinberg HWE sau khi hiệu chỉnh Bonferroni. Kết quả cho thấy bộ chỉ thị microstellite mới phát triển có độ đa hình cao và có tiềm năng phục vụ cho các mục đích trong chọn giống lâu dài trên cá Tra. Từ khóa chỉ thị microsatellite đa dạng di truyền multiplex PCR Pangasianodon hypophthalmus. I. MỞ ĐẦU nhiên một trong những thách thức hiện nay của Nghề nuôi cá Tra Pangasianodon chương trình chọn giống là xây dựng thông tin hypophthalmus Sauvage 1878 rất phổ biến ở phả hệ nhằm ước tính chính xác các thông số di vùng Đồng bằng sông Cửu Long từ năm 1960 truyền và kiểm soát sự cận huyết nhằm nâng cao và trở thành đối tượng cho sự phát triển của nuôi hiệu quả chọn giống Liu và ctv. 2018 . trông thủy sản nhờ hệ thủy sinh đặc thù ở khu Microsatellite là những đoạn ADN ngắn vực này Phan và ctv. 2009 . Riêng ở Việt Nam chứa một motif từ 1