tailieunhanh - Xác định, phân nhóm virus gây bệnh viêm phế quản truyền nhiễm trên gà năm 2018 ở đồng bằng sông Cửu Long

Tám chuỗi nucleotide của gen nucleoprotein (N) gồm 403 bp đã được thu nhận từ 7 mẫu bệnh phẩm IBV trên gà nuôi ở hai tỉnh Sóc Trăng và Vĩnh Long bằng PCR và giải trình tự. Trình tự nucleotide gen N của IBV được đưa vào sắp xếp so sánh, phân tích phả hệ (25 chủng) và tính toán khoảng cách di truyền (20 chủng). | KHOA HỌC KỸ THUẬT THÚ Y TẬP XXVI SỐ 5 - 2019 XAÙC ÑÒNH PHAÂN NHOÙM VIRUS GAÂY BEÄNH VIEÂM PHEÁ QUAÛN TRUYEÀN NHIEÃM TREÂN GAØ NAÊM 2018 ÔÛ ÑOÀNG BAÈNG SOÂNG CÖÛU LONG Lê Thị Kim Xuyến1 Nguyễn Thị Cẩm Loan2 Trần Ngọc Bích Đoàn Thị Thanh Hương1 4 Lê Thanh Hòa1 4 3 TÓM TẮT Tám chuỗi nucleotide của gen nucleoprotein N gồm 403 bp đã được thu nhận từ 7 mẫu bệnh phẩm IBV trên gà nuôi ở hai tỉnh Sóc Trăng và Vĩnh Long bằng PCR và giải trình tự. Trình tự nucleotide gen N của IBV được đưa vào sắp xếp so sánh phân tích phả hệ 25 chủng và tính toán khoảng cách di truyền 20 chủng . Kết quả nghiên cứu cho thấy giữa 8 chủng của Việt Nam một số nhóm chủng có khoảng cách di truyền rất thấp cụ thể 0-0 2 giữa 3 chủng IBST3 IBST4 IBST9 0 5 giữa 2 chủng IBST5-1 và IBST5-2 và 0 giữa IBST14 và IBVL22. Phân tích phả hệ đã chia 25 chủng IBV thành 2 nhóm chính bao gồm Nhóm 1 tập hợp các mẫu của thế giới và 3 mẫu IBV phân lập năm 2018 tại Sóc Trăng IBST4 IBST3 IBST9 với chủng vacxin 4-91 KF377577 và 2 chủng IBST5-1 IBST5-2 cùng với Mass41 AY851295 và nhóm 2 gồm các chủng có nguồn gốc hoàn toàn từ Trung Quốc và 2 chủng phân lập ở Vĩnh Long IBVL17 IBVL22 và 1 chủng phân lập ở Sóc Trăng IBST14 cùng với QX và LX4 QX-like của Trung Quốc. Có ít nhất 3 nhóm IBV đã xác định được là đang nhiễm trên đàn gà và có sự đa nhiễm trên cùng một cá thể trong đó có nhóm 4-91 Mass Mass41 và QX LX4 hay QX-like phân lập năm 2018 tại Sóc Trăng và Vĩnh Long. Từ khóa IBV gen nucleoprotein khoảng cách di truyền Sóc Trăng Vĩnh Long phả hệ. Determining and grouping IBV in chicken in Mekong Delta 2018 Le Thi Kim Xuyen Nguyen Thi Cam Loan Tran Ngoc Bich Doan Thi Thanh Huong Le Thanh Hoa SUMMARY There were 8 nucleotide sequences of the nucleoprotein gene N including 403 bp collected from 7 IBV specimens on the chickens raising in Soc Trang and Vinh Long provinces identified by PCR and sequencing. The nucleotide sequences of gene N of IBV were arranged and compared. The pedigree of 25 strains was analyzed and genetic .