tailieunhanh - Lắp ráp, chú giải và phân tích hệ phiên mã tôm sú Penaeus monodon

Tôm sú (Penaeus monodon) là loài thủy sản đem lại nguồn lợi lớn cho quốc gia trong những năm gần đây. Tuy nhiên, các dữ liệu về hệ gene và hệ phiên mã của chúng còn hạn chế. Mặc dù công việc gia hóa sử dụng các biện pháp di truyền chọn giống đã nâng cao chất lượng tôm sú. | VIEÄN NGHIEÂN CÖÙU NUOÂI TROÀNG THUÛY SAÛN 2 LẮP RÁP CHÚ GIẢI VÀ PHÂN TÍCH HỆ PHIÊN MÃ TÔM SÚ Penaeus monodon Nguyễn Cường1 Phạm Quang Huy1 Nguyễn Văn Lâm1 Hà Thị Thu1 Phạm Thị Hoa1 Nguyễn Hải Triều1 Đậu Huy Tùng1 Nguyễn Giang Thu2 Nguyễn Hữu Ninh3 Đồng Văn Quyền1 Chu Hoàng Hà1 Đinh Duy Kháng1 TÓM TẮT Tôm sú Penaeus monodon là loài thủy sản đem lại nguồn lợi lớn cho quốc gia trong những năm gần đây. Tuy nhiên các dữ liệu về hệ gene và hệ phiên mã của chúng còn hạn chế. Mặc dù công việc gia hóa sử dụng các biện pháp di truyền chọn giống đã nâng cao chất lượng tôm sú. Tuy nhiên nhu cầu giải mã và phân tích hệ gene hệ phiên mã của của tôm sú để tìm ra các chỉ thị phân tử cũng như các dữ liệu quan trọng khác sẽ giúp tăng hiệu suất cho quá trình chọn giống. Trong bài báo này chúng tôi công bố kết quả giải trình tự hệ phiên mã của tôm sú bằng công nghệ đọc trình tự thế hệ mới. Với 9 Gb dữ liệu thu được từ máy Illumina MiSeq chúng tôi tiến hành lắp ráp de novo để tạo ra ngân hàng với transcript từ đó thực hiện chú giải chức năng transcript phát hiện được chỉ thị phân tử microsatellite và SNP. Chúng tôi xây dựng hệ thống website quản lý các ngân hàng transcript cũng như các công cụ phân tích cần thiết. Kết quả của bài báo là tiền đề cho các nghiên cứu chuyên sâu hơn về loài tôm sú mang lại nguồn lợi lớn này. Từ khóa hệ phiên mã lắp ráp de novo giải trình tự thế hệ mới chú giải biểu hiện gene microsat- ellite SNP. I. ĐẶT VẤN ĐỀ tử để nâng cao năng suất nuôi về tính trạng Động vật giáp xác chiếm 10 tổng sản tăng trưởng và kháng bệnh là rất cần thiết. lượng thủy sản của cả thế giới và là một trong Hiện nay nguồn dữ liệu về tôm sú P. những lĩnh vực nuôi trồng thủy sản tăng trưởng monodon còn khá khiêm tốn Andriantahina và nhanh nhất trung bình 15 hằng năm từ năm ctv. 2013 . Trên ngân hàng Genbank có tổng 1970 và đạt 5 triệu tấn vào năm 2008 FAO cộng EST được ứng dụng vào tìm các 2010 . Trong đó tôm là sản phẩm thủy sản điểm đa hình ví dụ như SNP và

• Ngư nghiệp
• Nuôi trồng thủy sản
• Bài viết về ngư nghiệp
• Hệ phiên mã
• Lắp ráp de novo
• Giải trình tự thế hệ mới
• Biểu hiện gene
• Nuôi trồng thủy sản hữu cơ
• Phát triển nuôi trồng thủy sản
• Cải thiện nuôi trồng thủy sản
• Hướng phát triển nghề nuôi trồng thủy sản
• Môi trường thủy sản hữu cơ
• Nuôi trồng thủy sản bền vững
• Quy tắc nuôi trồng thủy sản
• Vị trí của nuôi trồng thủy sản
• Phát triển nghề nuôi trồng thủy sản
• hướng dẫn nuôi trồng thủy sản
• kỹ thuật nuôi trồng thủy sản
• kinh nghiệm nuôi trồng thủy sản
• cẩm nang nuôi trồng thủy sản
• phương pháp nuôi trồng thủy sản
• Dự án nuôi trồng thủy sản
• Quy hoạch chi tiết nuôi trồng thủy sản
• Nuôi trồng thủy sản huyện Bình Đại
• Nuôi trồng thủy sản huyện Ba Tri
• Báo cáo nuôi trồng thủy sản
• Mô hình trồng lúa kết hợp thủy sản
• Mô hình trồng lúa
• Mô hình nuôi trồng thủy sản
• Nuôi trồng thủy sản ở Hà Trung
• Trồng lúa kết hợp nuôi trồng thủy sản
• Thủy sản đồng bằng Sông Cửu Long
• Bảo vệ môi trường nuôi trồng thủy sản
• Thực trạng nuôi trồng thủy sản
• Tác động môi trường nuôi trồng thủy sản
• Ô nhiễm môi trường nuôi trồng thủy sản
• Nỗi lo nuôi trồng thủy sản
• Khó khăn nuôi trồng thủy sản
• Hạn chế nuôi trồng thủy sản
• Rủi ro nuôi trồng thủy sản
• Bệnh thường gặp ở thủy sản
• Vacxin trong nuôi trồng thủy sản
• Vấn đề nuôi trồng thủy sản
• Sử dụng vacxin trong nuôi trồng thủy sản
• Cách sử dụng vacxin phòng bệnh thủy sản
• Nghiên cứu vacxin trong nuôi trồng thủy sản
• Hệ thống nuôi trồng thủy sản
• Quản lý nuôi trồng thủy sản
• Cán bộ nuôi trồng thủy sản
• Bệnh học thủy sản
• Đặc điểm hệ thống nuôi trồng thủy sản
• Nuôi trồng thủy sản ở Lạng Giang
• Bước đột phá nuôi trồng thủy sản
• Lĩnh vực nuôi trồng thủy sản
• Sản xuất nông nghiệp
• Đột phá nuôi trồng thủy sản
• Mẫu báo cáo
• Mẫu Báo cáo nuôi trồng thủy sản
• Hoạt động nuôi trồng thủy sản
• Loại hình kinh tế doanh nghiệp
• Sản lượng thủy sản nuôi trồng