tailieunhanh - Xác định tham số quan trọng cho việc thiết kế gen dùng trong tái tổ hợp

Bài viết này trình bày kết quả khảo sát các tham số ảnh hưởng đến tối ưu hóa gen từ các chương trình đang được sử dụng hiện nay như: Eugene, GeneOptimizer, VisualGeneDeveloper, OptimumGene. Đánh giá các tiêu chí tối ưu hóa của chương trình giữa gen tự nhiên và gen tối ưu hóa trên cùng bộ gen MHA5. Các kết quả thống kê được dùng để xác định các tham số quan trọng cho việc thiết kế gen dùng trong tái tổ hợp. | Kỷ yếu Hội nghị Khoa học Quốc gia lần thứ IX Nghiên cứu cơ bản và ứng dụng Công nghệ thông tin FAIR 9 Cần Thơ ngày 4-5 8 2016 DOI XÁC ĐỊNH THAM SỐ QUAN TRỌNG CHO VIỆC THIẾT KẾ GEN DÙNG TRONG TÁI TỔ HỢP Dương Thị Kim Chi1 Trần Văn Lăng2 3 Lê Mậu Long3 1 Khoa Công nghệ Thông tin Trường Đại học Thủ Dầu Một 2 Viện Cơ học và Tin học ứng dụng Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam 3 Khoa Công nghệ thông tin Trường Đại học Nguyễn Tất Thành chidtk@ langtv@ lmlong@ TÓM TẮT Việc sử dụng các gen tự nhiên trong quá trình sản xuất các sản phẩm tái tổ hợp dùng trong y học dược học hay cải tạo giống cây trồng trong nông nghiệp thường cho kết quả biểu hiện thấp. Việc thiết kế gen hay tối ưu hóa gen đã được tiến hành nghiên cứu của nhóm Hugo G Menzella năm 2011. Vào năm 2014 nhóm Agnieszka Zylicz-Stachula năm 2014 chứng minh khả năng gia tăng mức độ biểu hiện của gen mục tiêu sau khi tối ưu hóa so với gen tự nhiên ban đầu. Bài viết này trình bày kế t quả khảo sát các tham số ảnh hưởng đến tối ưu hóa gen từ các chương trình đang được sử dụng hiện nay như Eugene GeneOptimizer VisualGeneDeveloper OptimumGene. Đánh giá các tiêu chí tối ưu hóa của chương trình giữa gen tự nhiên và gen tối ưu hóa trên cùng bộ gen MHA5. Các kết quả thống kê được dùng để xác định các tham số quan trọng c ho việc thiết kế gen dùng trong tái tổ hợp. Từ khóa Tối ưu sinh tin học I. GIỚI THIỆU Phân tử DNA tái tổ hợp recombinant DNA technology đầu tiên trong ống nghiệm in vitro được ra đời từ những năm đầu của thập niên 1970 đó là cơ sở cho sự ra đời của công nghệ sinh học hiện đại kỹ thuật di truyền genetic engineering 1 . Sự ra đời và phát triển nhanh chóng của lĩnh vực này không những đã đưa lại sự hiểu biết sâu sắc về cấu trúc và các cơ chế hoạt động của các gen và bộ gen mà còn trở thành lực lượng sản xuất trực tiếp của xã hội góp phần giải quyết những vấn đề thực tiễn đặt ra trong y dược học nông nghiệp và môi trường. Việc sản xuất protein tái tổ .