tailieunhanh - Một phương pháp phân tích mạng tương tác protein để dự đoán gen gây bệnh ung thư

Trong bài báo này, tác giả đề xuất một phương pháp tính toán dựa trên việc phân tích một mạng tích hợp các thông tin: mạng tương tác protein, mạng tương tác microRNA-gen, và các gen gây bệnh ung thư đã biết. Từ mạng tích hợp này, chúng tôi đưa ra phương pháp biểu diễn mới cho các gen dựa vào các tương tác trực tiếp và gián tiếp với các gen khác trong mạng. | JOURNAL OF SCIENCE OF HNUE FIT. 2013 Vol. 58 pp. 38-46 This paper is available online at http MỘT PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH MẠNG TƯƠNG TÁC PROTEIN ĐỂ DỰ ĐOÁN GEN GÂY BỆNH UNG THƯ Trần Thị Bích Phương1 Nguyễn Văn Huấn2 Trần Đăng Hưng2 1 Trường Đại học Tây Nguyên 2 Khoa Công nghệ Thông tin Trường Đại học Sư Phạm Hà Nội 2 Email hungtd@ Tóm tắt. Dự đoán gen gây bệnh là một trong những mục tiêu quan trọng trong nghiên cứu y sinh. Mặc dù hiện nay đã có khá nhiều phương pháp được xây dựng để dự đoán các gen liên quan đến một số bệnh cụ thể. Tuy nhiên do mối quan hệ phức tạp giữa các gen và bệnh nên rất nhiều các gen là nguyên nhân gây ra một số bệnh di truyền hiện vẫn chưa được phát hiện ra. Trong bài báo này chúng tôi đề xuất một phương pháp tính toán dựa trên việc phân tích một mạng tích hợp các thông tin mạng tương tác protein mạng tương tác microRNA-gen và các gen gây bệnh ung thư đã biết. Từ mạng tích hợp này chúng tôi đưa ra phương pháp biểu diễn mới cho các gen dựa vào các tương tác trực tiếp và gián tiếp với các gen khác trong mạng. Các thông tin này sau đó được dùng để dự đoán một gen có phải là gen gây bệnh ung thư hay không. Chúng tôi đã áp dụng phương pháp đề xuất vào dữ liệu thực tế được download từ các trung tâm dữ liệu sinh học trên thế giới và sử dụng các phương pháp phân lớp phổ biến để đánh giá hiệu quả của phương pháp đề xuất. Kết quả cho thấy khi tích hợp thông tin về mạng tương tác microRNA thì độ chính xác của các phương pháp dự đoán được nâng lên. Điều này chứng tỏ thông tin về microRNA là hữu ích trong việc tiên lượng các gen gây bệnh. Từ khóa Phân tích mạng Protein Ung thư gen microRNA dữ liệu sinh học. 1. Mở đầu Ung thư là một trong những bệnh phổ biến và nguy hiểm trên thế giới hiện nay hàng năm có hàng trăm nghìn người chết vì bệnh này 1 2 . Việc tìm hiểu cơ chế và nguyên nhân gây bệnh ung thư là một trong những bài toán quan trọng trong y sinh. Các nguyên nhân có thể là do môi trường do ngoại cảnh nhưng một nguyên nhân

• Lịch sử - Văn hoá
• Phân tích mạng
• Dữ liệu sinh học
• Dự đoán gen gây bệnh
• Nghiên cứu y sinh
• Mạng tương tác protein
• Mạng tương tác microRNA gen
• Bài giảng Phân tích và thiết kế mạng
• Phân tích và thiết kế mạng
• Tổng quan về phân tích mạng
• Thiết kế mạng
• Mô hình TCP
• Bài giảng Phân tích mạng lưới cấp nước
• Phân tích mạng lưới cấp nước
• Phân tích mạng lưới cấp nước bằng chương trình Epanet
• Hướng dẫn cách sử dụng Epanet
• Không gian làm việc của Epanet
• Vẽ mạng lưới cấp nước
• Mô hình mô phỏng chất lượng nước
• Phân tích thiết kế hệ thống mạng
• Bài giảng Phân tích thiết kế mạng
• Hệ thống mạng
• Khảo sát nhu cầu dùng mạng
• Thiết kế tổng thể hệ thống mạng
• Khảo sát hệ thống mạng
• Phân tích mạng lưới
• Điểm đến Đà Nẵng
• Kỹ thuật phân tích mạng lưới
• Quản lý và tiếp thị điểm đến
• Đặc tính của cấu trúc mạng lưới
• Vai trò tác nhân trong mạng lưới
• Vị trí tác nhân trong mạng lưới
• Tổng quan về các thiết bị mạng
• Máy chủ mạng
• Card giao tiếp mạng
• Thiết kế mạng logic
• Chiến lược quản trị mạng
• Chiến lược an toàn mạng
• Lập trình mạng
• Bài giảng Lập trình mạng
• Phân tích gói tin mạng
• Phân tích mức Data link
• Phân tích mức Physical
• Phân tích mức Network
• Truyền thông và mạng máy tính
• Giáo trình Phân tích và thiết kế mạng máy tính
• Thiết kế mạng máy tính
• Thiết bị mạng Lan
• Xây dựng mạng Lan
• Mạng cục bộ
• Phân lớp ảnh trái cây
• Mạng Nơron tích chập sâu
• Hệ thống mạng nơron tích chập sâu
• Thiết kế hệ thống mạng nơron tích chập sâu
• Phân lớp dữ liệu
• Phân tích mạng xã hội
• Công cụ Nodexl
• Mạng xã hội
• Các bước phân tích mạng xã hội
• Hướng dẫn sử dụng công cụ Nodexl
• Cách sử dụng công cụ Nodexl
• Thiết kế hệ thống mạng
• Phân tích hệ thống mạng
• Bài giảng Hệ thống mạng
• Sơ đồ logic hệ thống mạng
• Xây dựng tường lửa kết nối Internet
• Tóm tắt Luận văn tốt nghiệp
• Website bán hàng qua mạng
• Bán hàng qua mạng
• Hệ thống website bán hàng qua mạng
• Thiết kế website bán hàng qua mạng
• Phân tích website bán hàng qua mạng
• Xã hội học
• Phân tích mạng lưới xã hội
• Mạng lưới xã hội
• Lý thuyết mạng lưới xã hội
• Khái niệm mạng lưới xã hội
• Phương pháp nghiên cứu mạng lưới xã hội
• Quản trị chiến lược
• Bài giảng Quản trị chiến lược
• Cách mạng công nghệ 4 0
• Phân tích môi trường vĩ mô
• Phân tích cấu trúc cạnh tranh thị trường
• Phân tích tổ hợp kinh doanh
• Nhận dạng hệ thống điện
• Phân loại hệ thống điện
• Hệ thống điện
• Mạng nơron kết hợp với phân tích Wavelet
• Phân tích Wavelet
• Phân tích lưu lượng kiểm thử
• Kiểm thử a b
• Mạng truyền thông
• Kiểm thử a b mạng truyền thông
• Traffic Analysis
• Phân tích lưu lượng kiểm thử a b
• Bài giảng An toàn điện
• An toàn điện
• Phân tích mạng điện đơn giản
• Phân tích mạng 3 pha
• Điện dung lưới điện
• Trường điện từ
• Phân tích mạng lưới đô thị
• Mạng lưới đô thị
• Mạng lưới đô thị Việt Nam
• Tiềm năng kinh tế đô thị
• Chức năng các đô thị
• Mạng lưới đô thị ở Việt Nam
• Mạng di động 5G
• Hiệu năng của mạng Femtocell mật độ cao
• Chuyển giao Femtocell to femtocell
• Mô hình mạng hàng đợi
• Phân tích hiệu năng của các femtocell
• Truyền thông di động 4G LTE
• Bài giảng Kỹ thuật tấn công
• Kỹ thuật tấn công
• Phòng thủ trên không gian mạng
• Công cụ phân tích an ninh mạng
• An ninh mạng
• Social Engineering
• Trộm cắp tài khoản
• Bài thuyết trình Thiết kế mạng
• Thiết kế hệ thống mạng trường mầm non
• Thiết kế hệ thống mạng trường học
• Phân tích thiết kế mạng
• Mô hình mạng trường học
• Bài giảng Cung cấp điện
• Giải tích mạng
• Thực hành cung cấp điện
• Thực hành giải tích mạng
• Hệ thống điện phân xưởng
• Lắp đặt hệ thống bù
• Trạm biến áp phân xưởng
• công nghệ thông tin
• quản trị mạng
• Phân Tích mạng ảo
• Thiết Lập Mạng Riêng ảo
• internet
• LAN
• WAN
• kỹ thuật máy tính
• lập trình
• tin học vi tính
• Hệ thống bán hàng qua mạng
• Thiết kế hệ thống bán hàng qua mạng
• Phân tích hệ thống bán hàng qua mạng
• Tiểu luận Công nghệ thông tin
• Biểu đồ hoạt động của use case
• Đặc tả các use case