tailieunhanh - Phân tích vai trò của gốc methionine trong cấu trúc họ nhân tố phiên mã ở đậu tương

Trong nghiên cứu này, 3 nhóm TF giàu Met cơ bản ở đậu tương, bao gồm ‘Basic helix-loop-helix’ (bHLH), ‘Basic leucine zipper’ (bZIP) và ‘Serum response factor’ (SRF) đã được khai thác để chứng minh giả thuyết về vai trò của Met liên quan đến cơ chế đáp ứng. Đặc tính lý hóa học của protein và khảo sát sự phân bố của các gốc Met trên phân tử đã được xem xét. | Tạp chí Khoa học Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam - Số 6 103 2019 PHÂN TÍCH VAI TRÒ CỦA GỐC METHIONINE TRONG CẤU TRÚC HỌ NHÂN TỐ PHIÊN MÃ Ở ĐẬU TƯƠNG Chu Đức Hà1 Lê Minh Tuấn1 2 Phạm Phương Thu2 Phạm Thị Lý Thu1 Phạm Thị Xuân3 La Việt Hồng2 Phạm Xuân Hội1 TÓM TẮT Methionine Met là một axít amin đóng vai trò thiết yếu ở thực vật. Các gốc Met cấu trúc được giả thuyết là bảo vệ protein chống lại bất lợi ôxi hóa nội bào. Trong nghiên cứu này 21 phân tử protein giàu Met thuộc ba nhóm nhân tố phiên mã TF lần lượt là Basic helix-loop-helix bHLH Basic leucine zipper bZIP và Serum response factor SRF ở đậu tương Glycine max đã được phân tích nhằm chứng tỏ giả thuyết trên. Kết quả phân tích đã đưa ra 15 MRP có sự phân bố dày đặc của gốc Met trên hai khoảng ngoại biên quanh vùng bảo thủ. Phân tích tin sinh học cho thấy các TF đều ưa nước và hầu như không bền vững trong ống nghiệm. Trong đó một số TF có thể phân bố trong tế bào chất ty thể hoặc trên hệ thống bao gói. Dựa trên dữ liệu biểu hiện trong điều kiện thường phần lớn các gen mã hóa họ bHLH và bZIP đều có xu hướng tăng cường biểu hiện ở ít nhất một cơ quan chính. Phân tích dữ liệu RNA-Seq cho thấy một số gen mã hóa họ bHLH và SRF có mức độ phiên mã đáp ứng trong khi các gen mã hóa họ bZIP có đáp ứng tăng ở rễ đậu tương xử lý mặn. Từ khóa Bất lợi đậu tương Methionine nhân tố phiên mã tin sinh học I. ĐẶT VẤN ĐỀ tế bào trong đó 20 MRP liên quan đến điều hòa Dưới tác động của ngoại cảnh bất lợi sự dư thừa phiên mã ở đậu tương Chu et al. 2016 . Như đã của một số dạng chứa ôxi nguyên tử hoạt động đã biết nhân tố phiên mã TF là họ protein tham gia gây ra những tổn thương đến các đại phân tử ảnh điều hòa sự biểu hiện của gen vì vậy liên quan đến hưởng tiêu cực đến sinh trưởng và phát triển của cơ chế đáp ứng và khả năng chống chịu với điều .