tailieunhanh - Ứng dụng một số phần mềm phân tích mã vạch DNA để định danh cây dược liệu

Bài viết giới thiệu ba phần mềm để định danh cây dược liệu với ví dụ minh họa là định danh mẫu Thổ nhân sâm (Talinum paniculatum) bằng mã vạch vùng ITS. Kết quả nghiên cứu của bài báo cho thấy quy trình phối hợp ba phần mềm để định danh cây dược liệu bằng DNA cho kết quả chính xác nhất. | Ứng dụng một số phần mềm phân tích mã vạch DNA để định danh cây dược liệu TNU Journal of Science and Technology 225 08 98 - 104 ỨNG DỤNG MỘT SỐ PHẦN MỀM PHÂN TÍCH MÃ VẠCH DNA ĐỂ ĐỊNH DANH CÂY DƯỢC LIỆU Vũ Thị Như Trang Trường Đại học Y Dược - ĐH Thái Nguyên TÓM TẮT Định danh cây dược liệu bằng mã vạch DNA ngày càng phổ biến do tính chính xác cao. Để định danh được bằng mã vạch DNA các nhà nghiên cứu thường sử dụng các phần mềm máy tính giúp phân tích so sánh trình tự DNA của mẫu nghiên cứu với các trình tự có sẵn trên Genbank. Do dữ liệu trình tự gen được công bố tăng nhanh về số lượng nên để tiến hành phân tích hiệu quả các dữ liệu này các phần mềm cần phải dễ sử dụng có khả năng tính toán nhanh chính xác và cung cấp nhiều phương pháp thống kê khác nhau. Trong nhóm các phần mềm này thì ba phần mềm BLAST trong NCBI BioEdit MEGA 7 được sử dụng phổ biến nhất do đáp ứng được các yêu cầu trên. Bài báo giới thiệu ba phần mềm để định danh cây dược liệu với ví dụ minh họa là định danh mẫu Thổ nhân sâm Talinum paniculatum bằng mã vạch vùng ITS. Kết quả nghiên cứu của bài báo cho thấy quy trình phối hợp ba phần mềm để định danh cây dược liệu bằng DNA cho kết quả chính xác nhất. Từ khóa Phần mềm BLAST BioEdit MEGA 7 Cây dược liệu mã vạch DNA Thổ nhân sâm vùng ITS Ngày nhận bài 14 4 2020 Ngày hoàn thiện 08 6 2020 Ngày đăng 11 6 2020 APPLICATION OF SOME DNA BARCODE ANALYSIS SOFTWARE TO IDENTIFY MEDICINAL PLANTS Vu Thi Nhu Trang TNU - University of Medicine and Pharmacy ABSTRACT The identification of medicinal plants with DNA barcodes is increasingly popular due to its high accuracy. To identify using DNA barcodes researchers often use computer software to analyze and compare DNA barcodes of research samples with barcodes available on Genbank. Because the published gene sequence data increases rapidly in number in order to conduct an effective analysis of these data the software needs to be easy to use able to calculate quickly accurately and provide many .