tailieunhanh - Tóm tắt luận án Tiến sĩ Khoa học máy tính: Phân loại trình tự metagenomics trên cơ sở phân lớp và gom cụm

Luận án đề xuất giải pháp MetaAB và MetaAB-adv cho phép phân loại trình tự metagenomics dựa trên sự phong phú của hệ gien trong tập dữ liệu. Giải pháp BiMeta cho phép phân loại trình tự metagenomics dựa trên đặc trưng hợp thành, không sử dụng cơ sở dữ liệu tham khảo. Giải pháp SeMeta cho phép phân loại trình tự metagenomics có sử dụng cơ sở dữ liệu tham khảo. | Tóm tắt luận án Tiến sĩ Khoa học máy tính: Phân loại trình tự metagenomics trên cơ sở phân lớp và gom cụm ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP. HỒ CHÍ MINH TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA LÊ VĂN VINH PHÂN LOẠI TRÌNH TỰ METAGENOMICS TRÊN CƠ SỞ PHÂN LỚP VÀ GOM CỤM Chuyên ngành: Khoa học Máy tính Mã số chuyên ngành: TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SĨ KỸ THUẬT TP. HỒ CHÍ MINH NĂM 2016 Công trình được hoàn thành tại Trường Đại học Bách Khoa - ĐHQG-HCM Người hướng dẫn khoa học 1: PGS. TS. Trần Văn Lăng Người hướng dẫn khoa học 2: PGS. TS. Trần Văn Hoài Phản biện độc lập 1: Phản biện độc lập 2: Phản biện 1: Phản biện 2: Phản biện 3: Luận án sẽ được bảo vệ trước Hội đồng chấm luận án họp tại vào lúc giờ ngày tháng năm Có thể tìm hiểu luận án tại thư viện: - Thư viện Khoa học Tổng hợp Tp. HCM - Thư viện Trường Đại học Bách Khoa – ĐHQG-HCM DANH MỤC CÔNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ Tạp chí: [1].L. V. Vinh, T. V. Lang, and T. V. Hoai, "A novel semi-supervised algorithm for the taxonomic assignment of metagenomic reads," BMC Bioinformatics, , , ISSN: 1471-2105, 2016 (SCIE index, IF=). [2].L. V. Vinh, T. V. Lang, L. T. Binh, and T. V. Hoai, "A two-phase binning algorithm using l-mer frequency on groups of non-overlapping reads," Algorithms for Molecular Biology, vol. 10, , ISSN: 1748- 7188, 2015 (SCIE index, IF=). [3].L. V. Vinh, T. V. Lang, and T. V. Hoai, "A novel l-mer counting method for abundance based binning of metagenomic reads." Journal of Computer Science and Cybernetics, vol. 10, , ISSN 1813-9663, pp. 267-277, 2014. [4].L. V. Vinh, T. V. Lang, and T. V. Hoai, "Hiệu năng của các giải pháp gom cụm trình tự metagenomic," Tạp chí Khoa học và Công nghệ, Viện Hàn Lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam, vol. 52, , ISSN: 0866- 708X, , 2014. Hội nghị: [1].L. V. Vinh, T. V. Lang, and T. V. Hoai, "MetaAB-A Novel Abundance-