tailieunhanh - Phân tích họ gene mã hóa β-amylase ở cây sắn (Manihot esculenta Crantz) bằng phương pháp tin sinh học

Các beta-amylase (β-amylase, EC ) thuộc họ glycosyl hydrolase 14 có chức năng phân cắt các liên kết (1,4)-α-D-glycosidic trong các phân tử tinh bột, giải phóng các maltose từ đầu không khử của chuỗi. Sử dụng phương pháp tin sinh học, tổng số 10 gene mã hóa β-amylase đã được xác định trong hệ gene của cây sắn. Các gene β-amylase của cây sắn phân bố trên 5 trong tổng số 18 nhiễm sắc thể. | Phân tích họ gene mã hóa β-amylase ở cây sắn (Manihot esculenta Crantz) bằng phương pháp tin sinh học KHOA HỌC TỰ NHIÊN Phân tích họ gene mã hóa β-amylase Ở CÂY SẮN (Manihot esculenta Crantz) BẰNG PHƯƠNG PHÁP TIN SINH HỌC Cao Phi Bằng Khoa Khoa học Tự nhiên – Trường Đại học Hùng Vương Nhận bài ngày 10/11/2017, Phản biện xong ngày 25/11/2017, Duyệt đăng ngày 26/11/2017 TÓM TẮT C ác beta-amylase (β-amylase, EC ) thuộc họ glycosyl hydrolase 14 có chức năng phân cắt các liên kết (1,4)-α-D-glycosidic trong các phân tử tinh bột, giải phóng các maltose từ đầu không khử của chuỗi. Sử dụng phương pháp tin sinh học, tổng số 10 gene mã hóa β-amylase đã được xác định trong hệ gene của cây sắn. Các gene β-amylase của cây sắn phân bố trên 5 trong tổng số 18 nhiễm sắc thể. Dựa trên kết quả phân tích cây phả hệ, các β-amylase của cây sắn được xếp vào bốn phân họ khác nhau, gồm phân họ I, II, III và IV. Các gene này mã hóa không liên tục với số lượng intron thay đổi theo phân họ và theo từng gene trong phân họ. Các protein suy diễn của chúng có mức tương đồng khá cao khi so với các β-amylase cùng phân họ của cây Arabidopsis. Các protein β-amylase của cây sắn có điểm đẳng điện (pI) dao động từ 5,44 tới 8,92. Tất cả các β-amylase của cây sắn đều mang vùng bảo thủ của họ enzyme glycosyl hydrolase 14 và hầu hết trong số chúng có mang các amino acid giữ vai trò quan trọng đối với chức năng enzyme. Ngoài ra, MeBAM5 và MeBAM10 còn chứa đoạn amino acid giống với vùng bảo thủ của tác nhân điều hòa phiên mã chống chịu với Brassinazole ở đầu amin. Từ khóa: β-amylase, cây sắn, cây phả hệ, đặc trưng của gene, tin sinh học. 1. Đặt vấn đề cận nhiệt đới châu Phi, châu Á và châu Mỹ, Cây sắn (Manihot esculenta Crantz) là cây trong đó có Việt Nam [10]. Củ sắn là nguồn lương thực quan trọng thứ 6 trên thế giới cung cấp lương thực cho khoảng 800 triệu chỉ sau cây lúa mì, cây lúa gạo, cây ngô, cây người trên toàn cầu, mặc dù .