tailieunhanh - Nghiên cứu tương tác và khai thác dữ liệu biểu hiện giữa các tiểu phần của yếu tố nhân y ở loài đậu gà (Cicer arietinum)

Nghiên cứu về tương tác protein và mức độ biểu hiện của gen mã hóa protein đích được xem là những công cụ hỗ trợ đắc lực cho việc đưa ra giả thuyết về chức năng của gen. Trong nghiên cứu này, khả năng tương tác giữa ba tiểu phần của nhân tố phiên mã Yếu tố nhân Y (NF-Y) và mức độ biểu hiện của các gen mã hóa đã được phân tích trên cây đậu gà (Cicer arietinum). | Nghiên cứu tương tác và khai thác dữ liệu biểu hiện giữa các tiểu phần của yếu tố nhân y ở loài đậu gà (Cicer arietinum) ISSN: 1859-2171 TNU Journal of Science and Technology 225(01): 11 - 16 e-ISSN: 2615-9562 NGHIÊN CỨU TƯƠNG TÁC VÀ KHAI THÁC DỮ LIỆU BIỂU HIỆN GIỮA CÁC TIỂU PHẦN CỦA YẾU TỐ NHÂN Y Ở LOÀI ĐẬU GÀ (Cicer arietinum) Chu Đức Hà1, Lê Thị Ngọc Quỳnh2* 1Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam, 2Đại học Thủy lợi TÓM TẮT Nghiên cứu về tương tác protein và mức độ biểu hiện của gen mã hóa protein đích được xem là những công cụ hỗ trợ đắc lực cho việc đưa ra giả thuyết về chức năng của gen. Trong nghiên cứu này, khả năng tương tác giữa ba tiểu phần của nhân tố phiên mã Yếu tố nhân Y (NF-Y) và mức độ biểu hiện của các gen mã hóa đã được phân tích trên cây đậu gà (Cicer arietinum). Kết quả mô hình hóa interactome đã cho thấy tiểu phần CaNF-YB có thể kết hợp chặt chẽ với CaNF-YC thành dạng nhị hợp, sau đó tương tác với CaNF-YA tạo thành phức hợp CaNF-Y hoàn chỉnh, tương tự như ở các loài thực vật khác. Trong đó, bốn dạng kết hợp của ba tiểu phần đã được dự đoán là [(CaNF-YB19/-YC01)/-YA06], [(CaNF-YB19/-YC01)/-YA02], [(CaNF-YB18/-YC01)/-YA06] và [(CaNF-YB18/-YC01)/-YA02]. Tiếp theo, cấu trúc vùng bảo thủ của các tiểu phần CaNF-YA có tương tác đều chứa hai vùng riêng biệt, là đoạn nhận biết, bám DNA và đoạn tương tác với cấu trúc CaNF-YB/YC. Cấu trúc vùng bảo thủ của các tiểu phần CaNF-YB và -YC có tương tác được ghi nhận với hai vùng tương tác với CaNF-YA và với CaNF-YC hoặc CaNF-YB. Khai thác dữ liệu phiên mã trước đây đã chỉ ra rằng các gen mã hóa tiểu phần CaNF-Y có tương tác đều thể hiện mức độ biểu hiện mạnh ở ít nhất một vị trí trong cây. Kết quả của nghiên cứu này đã gợi mở những dẫn liệu .

TỪ KHÓA LIÊN QUAN
crossorigin="anonymous">
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.