tailieunhanh - Định danh loài bằng mã vạch DNA và phân tích trình tự vùng ITS và đoạn gen rpoC1 của mẫu lan Kim tuyến thu tại huyện Thuận Châu, tỉnh Sơn La, Việt Nam

Lan Kim tuyến là loài cây dược liệu quý hiếm. Hiện nay ở nước ta được biết đến 12 loài lan Kim tuyến, trong đó có loài Anoectochilus setaceus. Do khai thác quá mức mà hiện nay các loài lan Kim tuyến có nguy cơ tuyệt chủng, chính vì vậy việc thu thập, định danh làm cơ sở cho việc lưu giữ, nhân giống góp phần bảo tồn và phát triển nguồn gen loài Lan Kim tuyến là rất cấp thiết. | Định danh loài bằng mã vạch DNA và phân tích trình tự vùng ITS và đoạn gen rpoC1 của mẫu lan Kim tuyến thu tại huyện Thuận Châu, tỉnh Sơn La, Việt Nam ISSN: 1859-2171 TNU Journal of Science and Technology 202(09): 107 - 114 e-ISSN: 2615-9562 ĐỊNH DANH LOÀI BẰNG MÃ VẠCH DNA VÀ PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ VÙNG ITS VÀ ĐOẠN GEN rpoC1 CỦA MẪU LAN KIM TUYẾN THU TẠI HUYỆN THUẬN CHÂU, TỈNH SƠN LA, VIỆT NAM Lò Thị Mai Thu1, Trịnh Thị Thủy2, Chu Hoàng Mậu3* 1 Trường Đại học Tây Bắc; 2Trường Trung học phổ thông Chuyên, Sơn La 3 Trường Đại học Sư phạm - ĐH Thái Nguyên TÓM TẮT Lan Kim tuyến là loài cây dược liệu quý hiếm. Hiện nay ở nước ta được biết đến 12 loài lan Kim tuyến, trong đó có loài Anoectochilus setaceus. Do khai thác quá mức mà hiện nay các loài lan Kim tuyến có nguy cơ tuyệt chủng, chính vì vậy việc thu thập, định danh làm cơ sở cho việc lưu giữ, nhân giống góp phần bảo tồn và phát triển nguồn gen loài Lan Kim tuyến là rất cấp thiết. Trong nghiên cứu này, chúng tôi trình bày kết quả định danh loài lan Kim tuyến thu tại Thuận Châu, Sơn La (LKT-SL) bằng mã vạch DNA dựa trên trình tự vùng ITS và đoạn gen rpoC1. Vùng ITS và đoạn gen rpoC1 phân lập từ mẫu LKT-SL có kích thước lần lượt là 666 bp và 628 bp. Trên cơ sở trình tự nucleotide của vùng ITS và đoạn gen rpoC1, bằng phần mềm BLAST trong NCBI, mẫu LKT-SL được xác định là loài Anoectochilus setaceus. Trình tự vùng ITS và đoạn gen rpoC1 của mẫu LKT-SL và các trình tự trên GenBank có tính bảo thủ cao, chỉ sai khác ở 2 vị trí nucleotide. Khoảng cách di truyền giữa mẫu LKT-SL và các mẫu trên GenBank dựa vào trình tự vùng ITS và đoạn gen rpoC1 thấp, ở mức 0,2%. Trình tự vùng ITS và đoạn gen rpoC1 có thể sử dụng làm mã vạch DNA để định danh loài Lan kim tuyến (Anoectochilus setaceus). Từ khóa: Anoectochilus setaceus, gen rpoC1, mã vạch DNA, Sơn La, vùng ITS. Ngày nhận bài: 27/5/2019;Ngày hoàn thiện: 26/6/2019; Ngày đăng: 15/7/2019 THE SPECIES IDENTIFICATION WITH