tailieunhanh - Ứng dụng kỹ thuật PCR chẩn đoán Piper yellow mottle virus gây hại trên hồ tiêu (Piper nigrum L.) ở Việt Nam

Piper yellow mottle virus (PYMoV) là một trong 2 loại virus gây hại chính trên hồ tiêu đã được phát hiện ở nhiều nước trên thế giới. Tuy nhiên, vấn đề chẩn đoán virus PYMoV trên hồ tiêu vẫn chưa được quan tâm nhiều tại Việt Nam. Để hỗ trợ cho việc chẩn đoán chính xác tác nhân gây bệnh virus trên hồ tiêu, trong đó có PYMoV, và sản xuất giống tiêu sạch virus ở Việt Nam, quy trình PCR đã được phát triển để chẩn đoán virus này. | Ứng dụng kỹ thuật PCR chẩn đoán Piper yellow mottle virus gây hại trên hồ tiêu (Piper nigrum L.) ở Việt Nam Tạp chí Khoa học Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam - Số 6(79)/2017 ỨNG DỤNG KỸ THUẬT PCR CHẨN ĐOÁN PIPER YELLOW MOTTLE VIRUS GÂY HẠI TRÊN HỒ TIÊU (Piper nigrum L.) Ở VIỆT NAM Nguyễn Xuân Dũng1, Dương Hoa Xô1 1 Trung tâm Công nghệ Sinh học Thành phố Hồ Chí Minh TÓM TẮT Piper yellow mottle virus (PYMoV) là một trong 2 loại virus gây hại chính trên hồ tiêu đã được phát hiện ở nhiều nước trên thế giới. Tuy nhiên, vấn đề chẩn đoán virus PYMoV trên hồ tiêu vẫn chưa được quan tâm nhiều tại Việt Nam. Để hỗ trợ cho việc chẩn đoán chính xác tác nhân gây bệnh virus trên hồ tiêu, trong đó có PYMoV, và sản xuất giống tiêu sạch virus ở Việt Nam, quy trình PCR đã được phát triển để chẩn đoán virus này. Theo đó, kỹ thuật PCR được áp dụng để khuếch đại đoạn gen có kích thước khoảng 450 bp hay 400 bp từ bộ gen virus với mồi PYMoI hay PYMoIII tương ứng. Quy trình chẩn đoán được sử dụng cho việc xác định sự hiện diện của virus ở các vườn trồng hồ tiêu tại các khu vực Tây Ninh, Đồng Nai và Đăk Lăk. Kết quả cho thấy đã phát triển thành công quy trình chẩn đoán PYMoV. Phản ứng PCR có thể phát hiện virus ở mức 100 bản sao/µL. Trình tự đoạn gen khuếch đại có độ tương đồng từ 85% - 87% so với trình tự đã được công bố trên Ngân hàng gen. Sự hiện diện của virus được ghi nhận ở tất cả các khu vực khảo sát với tỷ lệ nhiễm trung bình 41,12% (88 trong tổng số 214 mẫu). Tỷ lệ nhiễm virus cao nhất được ghi nhận tại Tây Ninh (57,69%) và thấp nhất tại Đồng Nai (24,51%). Kết quả này cho thấy PYMoV hiện đang gây nhiễm khá phổ biến trên hồ tiêu ở Việt Nam. Từ khóa: Bệnh virus, Piper yellow mottle virus, Piper nigrum, PCR, chẩn đoán virus I. ĐẶT VẤN ĐỀ quan trọng đối với việc chẩn đoán bệnh virus trên Hồ tiêu (Piper nigrum L.) là một loại cây trồng có hồ tiêu ở trong nước. giá trị kinh tế hiện đang được trồng phổ biến ở Việt Nghiên cứu này được thực .