tailieunhanh - Tám gen mới được phát hiện ở hai chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm trùng hô hấp ở Bệnh viện Đa khoa Thống Nhất, Đồng Nai
Acinetobacter baumannii là tác nhân gây nhiễm khuẩn bệnh viện quan trọng với khả năng phát triển một loạt các cơ chế kháng đa thuốc khác nhau. Mục tiêu nghiên cứu này, chúng tôi giải mã hệ gen chủng A. baumannii DMS06669, được phân lập từ bệnh phẩm đờm của một nam bệnh nhân bị viêm phổi bệnh viện và nghiên cứu tập trung vào việc xác định các gen liên quan tới sự đề kháng kháng sinh. | Tám gen mới được phát hiện ở hai chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm trùng hô hấp ở Bệnh viện Đa khoa Thống Nhất, Đồng Nai CHUYÊN ĐỀ HÔ HẤP THỰC HÀNH TÁM GEN MỚI ĐƯỢC PHÁT HIỆN Ở HAI CHỦNG ACINETOBACTER BAUMANNII GÂY NHIỄM TRÙNG HÔ HẤP Ở BỆNH VIỆN ĐA KHOA THỐNG NHẤT, ĐỒNG NAI Nguyễn Sĩ Tuấn* và Phạm Hùng Vân** TÓM TẮT Objective: In this study, we characterized the Mở đầu: Acinetobacter baumannii là tác nhân genome of A. baumannii DMS06669 strain, which gây nhiễm khuẩn bệnh viện quan trọng với khả năng was isolated from the phlegm specimen of a male phát triển một loạt các cơ chế kháng đa thuốc khác patient with hospital acquired pneumonia and nhau. Mục tiêu nghiên cứu này, chúng tôi giải mã focused on identification of genes relevant to hệ gen chủng A. baumannii DMS06669, được phân antibiotic resistance. lập từ bệnh phẩm đờm của một nam bệnh nhân bị Method: The A. baumannii DMS0669 genome viêm phổi bệnh viện và nghiên cứu tập trung vào was sequenced on Illumina HiSeq platform, quality việc xác định các gen liên quan tới sự đề kháng controlled, and de novo assembled to produce a kháng sinh. total of 24 scaffolds, following gene prediction and Phương pháp: Hệ gen A. baumannii functional annotation to public databases such as DMS06669 được giải mã bằng Illumina HiSeq tRNAscan-SE, RNAmmer, Tandem Repeat Finder, platform, chất lượng được kiểm soát và việc lắp ráp CRISPR Finder, IS Finder and COG, then the de novo cho tổng cộng 24 scaffold, dự đoán gen và phylogeny tree of DMS06669 strain with 21 other A. chú giải chức năng tiếp theo với các dữ liệu trên thế baumannii strains on KEGG database was giới như tRNAscan-SE, RNAmmer, Tandem constructed. Repeat Finder, CRISPR Finder, IS Finder và COG, Results: The identification of potential antibiotic sau đó cây phát sinh loài của chủng A. baumannii resistance genes was conducted on ResFinder DMS06669 so với 21 chủng A. baumannii trên dữ yielding 18 genes (with 8 genes have .
đang nạp các trang xem trước
