tailieunhanh - Phân tích hệ Protein huyết thanh bệnh đái tháo đường Type 2

Trong nghiên cứu này, chúng tôi sử dụng phương pháp biến tính nhiệt, sắc ký ái lực và kít loại albumin và Ig để phân đoạn protein huyết thanh bệnh nhân đái tháo đường type 2 (ĐTĐT2). Hỗn hợp protein sau khi phân đoạn được thủy phân bằng enzyme trypsin, phân tích và nhận dạng bằng sắc ký lỏng 2 chiều kết nối khối phổ (2DnanoLC ESI-MS/MS). Các protein nhận dạng trong kết quả tìm kiếm, được định danh, phân loại dưới sự hỗ trợ của các công cụ sinh tin học (ID mapping, cơ sở dữ liệu trên Swissprot.) để tiến tới xây dựng cơ sở dữ liệu hệ protein huyết thanh. Kết quả đã xác định được 468 glycoprotein, 1110 protein của phân đoạn nhiệt và 4044 protein tổng số trong 30 mẫu huyết thanh bệnh nhân ĐTĐT2 ñã nghiên cứu. Đồng thời, đã phát hiện được 26 protein liên quan đến sự phát sinh và phát triển của bệnh ĐTĐT2. | Phân tích hệ Protein huyết thanh bệnh đái tháo đường Type 2 TẠP CHÍ SINH HỌC, 2012, 34(2): 253-258 PHÂN TÍCH HỆ PROTEIN HUYẾT THANH BỆNH ĐÁI THÁO ĐƯỜNG TYPE 2 Nguyễn Thị Minh Phương*, Phạm Đức Đan, Nguyễn Bích Nhi, Phan Văn Chi Viện Công nghệ sinh học, (*)minhphuongibt@ TÓM TẮT: Trong nghiên cứu này, chúng tôi sử dụng phương pháp biến tính nhiệt, sắc ký ái lực và kít loại albumin và Ig ñể phân ñoạn protein huyết thanh bệnh nhân ñái tháo ñường type 2 (ĐTĐT2). Hỗn hợp protein sau khi phân ñoạn ñược thủy phân bằng enzyme trypsin, phân tích và nhận dạng bằng sắc ký lỏng 2 chiều kết nối khối phổ (2DnanoLC ESI-MS/MS). Các protein nhận dạng trong kết quả tìm kiếm, ñược ñịnh danh, phân loại dưới sự hỗ trợ của các công cụ sinh tin học (ID mapping, cơ sở dữ liệu trên Swissprot.) ñể tiến tới xây dựng cơ sở dữ liệu hệ protein huyết thanh. Kết quả ñã xác ñịnh ñược 468 glycoprotein, 1110 protein của phân ñoạn nhiệt và 4044 protein tổng số trong 30 mẫu huyết thanh bệnh nhân ĐTĐT2 ñã nghiên cứu. Đồng thời, ñã phát hiện ñược 26 protein liên quan ñến sự phát sinh và phát triển của bệnh ĐTĐT2. Từ khóa: Cơ sở dữ liệu, ñái tháo ñường type 2, hệ protein, huyết thanh người, khối phổ. MỞ ĐẦU trypsin, phân tích và nhận dạng bằng sắc ký Huyết thanh là một thành phần quan trọng lỏng 2 chiều kết nối khối phổ (2DnanoLC ESI- trong máu, chứa các protein có nguồn gốc và MS/MS). Kết quả ñã xác ñịnh ñược 468 chức năng khác nhau, tác ñộng lên nhiều cơ glycoprotein, 1110 protein của phân ñoạn nhiệt quan và quá trình sinh học trong cơ thể. Bất kỳ và 4044 protein tổng số trong huyết thanh bệnh một thay ñổi nào liên quan ñến bệnh lý cũng nhân ĐTĐT2. Trong ñó, ñã xác ñịnh ñược 26 ñược phản ánh ña dạng và ñầy ñủ trong hệ protein liên quan ñến sự phát sinh và phát triển protein huyết thanh [2]. Vì vậy, việc sử dụng của bệnh ĐTĐT2 huyết thanh cho mục ñích nghiên cứu là cách PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU tiếp cận hợp lý và hứa hẹn sẽ mang lại .