tailieunhanh - Nghiên cứu xây dựng mô hình QSAR nhị phân và Pharmacophore trên các chất ức chế Cytochrom P450 2C9

Các enzym cytochrom P450 (CYP 450) tạo thành một họ các protein chứa heme chuyển hóa phần lớn các thuốc đang sử dụng trên thị trường. Khoảng 75% các thuốc được chuyển hóa bởi CYP 3A4, 2D6 và 2C9. Vì vậy, vấn đề tương tác thuốc, đặc biệt là tương tác với CYP P450 đang được các nhà khoa học quan tâm nghiên cứu. Do đó, việc xây dựng các mô hình dự đoán sự tương tác của các hợp chất này với CYP P450 2C9 cần được thực hiện. | Nghiên cứu xây dựng mô hình QSAR nhị phân và Pharmacophore trên các chất ức chế Cytochrom P450 2C9 Nghiên cứu Y học Y Học TP. Hồ Chí Minh * Phụ Bản Tập 23 * Số 2 * 2019 NGHIÊN CỨU XÂY DỰNG MÔ HÌNH QSAR NHỊ PHÂN VÀ PHARMACOPHORE TRÊN CÁC CHẤT ỨC CHẾ CYTOCHROM P450 2C9 Thái Khắc Minh*, Trần Thành Đạo* TÓMTẮT Mở đầu: Các enzym cytochrom P450 (CYP 450) tạo thành một họ các protein chứa heme chuyển hoá phần lớn các thuốc đang sử dụng trên thị trường. Khoảng 75% các thuốc được chuyển hóa bởi CYP 3A4, 2D6 và 2C9. Vì vậy, vấn đề tương tác thuốc, đặc biệt là tương tác với CYP P450 đang được các nhà khoa học quan tâm nghiên cứu. Do đó, việc xây dựng các mô hình dự đoán sự tương tác của các hợp chất này với CYP P450 2C9 cần được thực hiện. Mục tiêu: Hai phương phương pháp QSAR nhị phân (BQSAR) và pharmacophore được sử dụng để xây dựng mô hình phân biệt và dự đoán hoạt tính ức chế CYP 2C9. Đối tượng- Phương pháp nghiên cứu: Tổng cộng 139 chất với hoạt tính ức chế CYP 2C9 được sử dụng để xây dựng mô hình QSAR nhị phân. Mô hình 3D pharmacophore cho các chất ức chế CYP 2C9 được tiến hành xây dựng. Kết quả: Cơ sở dữ liệu thu thập được cho việc xây dựng các mô hình QSAR nhị phân bao gồm 79 chất được thử nghiệm có khả năng ức chế CYP 2C9 và 60 chất được xác định là cơ chất của CYP 2C9 và không có khả năng ức chế CYP 2C9. Tập hợp các chất được phân phối ngẫu nhiên hoặc đa dạng thành tập huấn luyện (80%) để xây dựng mô hình và tập kiểm tra (20%) để đánh giá mô hình. Mô hình QSAR nhị phân trên 7 thông số mô tả theo phương pháp phân chia ngẫu nhiên có độ chính xác của tập kiểm tra là 0,80, tập huấn luyện là 0,87; theo phương pháp phân chi đa dạng, mô hình có độ chính xác của tập kiểm tra là 0,90, tập huấn luyện là 0,86. Mô hình pharmacophore của các chất ức chế CYP 2C9 gồm 4 điểm (2 nhóm kỵ nước và nhóm nhận liên kết hydro) có độ đúng và độ chính xác lần lượt là 0,74 và 0,73. Kết luận: Các mô hình dự đoán được xây dựng có độ nhạy và độ